茸毛偃麥草1st染色體上重復(fù)序列分析與特異分子標(biāo)記開發(fā)

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1、ＩＬＴ＼Ｃ１ｒｖ７ｆ７Ｄｄ?。牐粒墸。牐┏忻可剑聪悖崳姡牐粒牛茫裕遥希危桑茫牐樱茫椋牐牛危茫牛牐粒危模牐裕牛茫龋危希蹋希牵伲牐希疲牐茫龋桑危粒崳姡眨危桑裕伲牐希疲牐牛蹋牐桑郑牛遥樱T±學(xué)位論文ＭＡＳＴＥＲＴＨＥＳＩＳｔ論文題目茸毛偃麥草１Ｓ染色體上重復(fù)序列分析＇與特異分子標(biāo)記開發(fā)學(xué)科專業(yè)生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)號２０１２２１０９０３０７：．＿＿戴剛作者姓名指導(dǎo)教師楊足君教授ｌｋ３－獨劍性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工。作及取得的研究成

2、果據(jù)我所知，除了文中特別加１＾標(biāo)注和致謝的地方外，也不包含，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果為獲得電子科技大學(xué)或其它教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我＾同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。？作者簽名：教如曰期：ｏＷＪ：年／月日論文使用授權(quán)本學(xué)位論文作者完全了解電子科技大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，有權(quán)保留并向國家有關(guān)部口或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)電子科技大學(xué)可１＾將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，可采用影印

3、、縮印或巧描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。（保密的學(xué)位論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定）作者簽名：古成導(dǎo)師簽名：；日期：月ａｌｌ曰ｏＷＪ年／分類號密級注1UDC學(xué)位論文茸毛偃麥草1St染色體上重復(fù)序列分析與特異分子標(biāo)記開發(fā)（題名和副題名）戴剛（作者姓名）指導(dǎo)教師楊足君教授電子科技大學(xué)成都（姓名、職稱、單位名稱）申請學(xué)位級別碩士學(xué)科專業(yè)生物化學(xué)與分子生物學(xué)提交論文日期2015.03.30論文答辯日期2015.05.27學(xué)位授予單位和日期電子科技大學(xué)2015年6月日答辯委員會主席評閱人注1：注明《國際十進(jìn)分類法UDC》的類號。Theanalysi

4、sofrepeatsequencesanddevelopmentofspecificmolecularmarkersforchromosome1StofThinopyrumintermediumssp.trichophorumAMasterThesisSubmittedtoUniversityofElectronicScienceandTechnologyofChinaMajor:BiochemistryandMolecularBiologyAuthor:GangDaiAdvisor:Prof.ZujunYangSchool:SchoolofLifeSci

5、enceandTechnology摘要摘要中間偃麥草（Thinopyrumintermedium,2n=6x=42,JJJsJsStSt）是小麥?zhǔn)种匾囊吧壩锓N，屬于小麥的三級基因庫，具有非常多的優(yōu)良基因，其適應(yīng)環(huán)境以及繁殖能力都很強，是小麥品質(zhì)改良過程十分重要的供體。茸毛偃麥草（Thinopyrumintermediumssp.Trichophorum）是中間偃麥草的一個新亞種。與中間偃麥草相比，它的不同之處在于不僅其穗部和葉片上都覆蓋有茸毛，而且染色體上的異染色質(zhì)條帶也有著十分明顯的差異。但是和中間偃麥草一樣，茸毛偃麥草也免疫小麥三銹，另外它還對

6、赤霉病表現(xiàn)為高抗。本研究通過分析茸毛偃麥草1St染色體上的串聯(lián)重復(fù)序列，獲知了該條染色體上串聯(lián)重復(fù)序列的基本組成以及分布特征，并通過SLAF-seq技術(shù)開發(fā)得到了一些茸毛偃麥草1St染色體特異分子標(biāo)記。本研究的具體內(nèi)容和研究結(jié)果如下：1利用開放軟件和自編程序?qū)θ酌塞湶?St染色體上的微衛(wèi)星和小衛(wèi)星序列進(jìn)行了查找、統(tǒng)計和分析，發(fā)現(xiàn)該染色體基因組中包含1,390個微衛(wèi)星和435個小衛(wèi)星。2在微衛(wèi)星中，發(fā)現(xiàn)重復(fù)數(shù)目最多的重復(fù)類型是二堿基重復(fù)，其次是三堿基重復(fù)，然后是單堿基重復(fù)，再往后依次是四堿基重復(fù)、五堿基重復(fù)和六堿基重復(fù)。在單堿基重復(fù)類型中，重復(fù)拷貝類型為A

7、的重復(fù)數(shù)目最多；二堿基重復(fù)類型中，AT的重復(fù)數(shù)目最多，其次是AC和AG；三堿基重復(fù)類型中，以AAT為重復(fù)拷貝類型的重復(fù)數(shù)目最多。在重復(fù)序列的數(shù)目頻率分布上，二堿基重復(fù)類型的重復(fù)序列數(shù)目近似為正態(tài)分布。3在小衛(wèi)星中，主要的重復(fù)類型是三堿基重復(fù)和四堿基重復(fù)，占九成的比例。重復(fù)數(shù)目最多的重復(fù)類型是十四堿基重復(fù)，小衛(wèi)星都是富含A/T的重復(fù)序列。小衛(wèi)星的重復(fù)單位長度分布界限為7-36，集中分布在7-25之間。隨著重復(fù)單位長度的增加，由對應(yīng)的重復(fù)序列數(shù)目大致上呈遞減的趨勢。4基于SLAF-seq技術(shù)，獲得了359個茸毛偃麥草1St染色體特異SLAF片段，隨機選擇114

8、個特異片段，通過引物設(shè)計，聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴增以及非變性聚丙烯酰胺凝