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《魁蚶轉(zhuǎn)錄組文庫的構(gòu)建分析及免疫相關(guān)基因的克隆、表達、抗菌活性研究》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、學(xué)校代碼：10264研究生學(xué)號：M120101017上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文魁蚶轉(zhuǎn)錄組文庫的構(gòu)建分析及免疫相關(guān)基因題目：的克隆、表達、抗菌活性研究Construction,AnalysisoftheTranscriptomeLibrary,andCloning,Expression,Antibacterial英文題目：ActivityStudyofImmune-relatedGenesinScapharcabroughtonii專業(yè)：水產(chǎn)養(yǎng)殖研究方向：貝類分子免疫姓名：鄭利兵指導(dǎo)教師：劉志鴻研究員
2、2015年4月10日謹以此文獻給我的導(dǎo)師劉志鴻研究員以及所有關(guān)心和支持我的人-------鄭利兵魁蚶轉(zhuǎn)錄組文庫的構(gòu)建分析及免疫相關(guān)基因的克隆、表達、抗菌活性研究學(xué)位論文完成日期：指導(dǎo)老師簽名：答辯委員會成員簽名：上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：我恪守學(xué)術(shù)道德，崇尚嚴(yán)謹學(xué)風(fēng)。所呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下，獨立進行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)明確注明和引用的內(nèi)容外，本論文不包含任何其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品及成果的內(nèi)容。論文為本人親自撰寫，我對所寫的內(nèi)容負責(zé)，并完全
3、意識到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名：日期：年月日上海海洋大學(xué)學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱或借閱。本人授權(quán)上海水產(chǎn)大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密□，在年解密后適用本版權(quán)書。本學(xué)位論文屬于不保密□學(xué)位論文作者簽名：指導(dǎo)教師簽名：日期：年月日日期：上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文答辯委員
4、會成員名單姓名工作單位職稱備注王清印黃海水產(chǎn)研究所研究員主席李琪中國海洋大學(xué)教授委員李軍中國科學(xué)院海洋研究所研究員委員李富花中國科學(xué)院海洋研究所研究員委員莊志猛黃海水產(chǎn)研究所研究員委員吳彪黃海水產(chǎn)研究所助理研究員秘書上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文魁蚶轉(zhuǎn)錄組文庫的構(gòu)建分析及免疫相關(guān)基因的克隆、表達和抗菌活性研究摘要魁蚶（Scapharcabroughtonii）屬于軟體動物門（Mollusc），雙殼綱（Bivalve），蚶目（Arcoida），蚶科（Arcoidae），毛蚶屬（Arca））。殼面有42-4
5、8條放射肋，以43條者居多。主要分布于我國渤海及黃海北部?？酪蚱鋫€體大、生長快，肉味鮮美，富含蛋白質(zhì)和多種維生素，具有很高的經(jīng)濟價值，是我國出口換匯率較高的水產(chǎn)品之一。近幾年來，我們課題組對魁蚶的血細胞形態(tài)、免疫功能及種質(zhì)資源和遺傳多樣性做過研究，發(fā)現(xiàn)魁蚶對鰻弧菌具有較強的抗菌功能。早期野生魁蚶資源豐富，市面上銷售的也都是野生捕撈種。近年來，近海養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴大和人類活動的日漸頻繁，導(dǎo)致灘涂生態(tài)環(huán)境惡化，加之過度捕撈，野生魁蚶群體出現(xiàn)病害和資源量下降的現(xiàn)象。為恢復(fù)其資源，魁蚶增殖放流和人工養(yǎng)殖
6、便應(yīng)運而生，且發(fā)展迅猛，為防止魁蚶在規(guī)模化養(yǎng)殖過程中爆發(fā)病害，需加強魁蚶抗病選育及其免疫機制研究。然而相關(guān)研究報道還較少，主要是運用傳統(tǒng)分析學(xué)方法在細胞水平上對血細胞及其免疫功能等進行一些基礎(chǔ)性的研究，有關(guān)魁蚶免疫系統(tǒng)作用的分子機制研究在國內(nèi)外幾乎還是空白。魁蚶功能基因的研究可為疾病防治提供理論基礎(chǔ)，因此發(fā)掘魁蚶免疫基因、加強免疫機制研究顯得尤為重要，深入挖掘魁蚶免疫因子對其產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重要的理論和現(xiàn)實意義。TM本研究通過IllumiaHiseq2000技術(shù)構(gòu)建并分析魁蚶轉(zhuǎn)錄組文庫。采用拼接軟件
7、Trinity對所得序列進行de-novo組裝，共獲得86,689條高質(zhì)量unigenes（>200bp），總長度為71,873,603bp，平均長度829bp，N50長度為2256bp，N90長度是454bp，最長的序列為33,269bp。通過BLAST比對進行基因功能注釋：共有22,117（25.51%）條unigenes在Nr數(shù)據(jù)庫中存在相似序列，分別有21,404（24.69%）、21,207（24.46%）條unigenes在GO和PFAM數(shù)據(jù)庫中注釋成功，在注釋成功的序列中有7,531
8、條序列被定位在31個KEGG的通路當(dāng)中。結(jié)果表明：構(gòu)建的魁蚶轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)量較高，篩選獲得的免疫相關(guān)unigenes為魁蚶功能基因的分子克隆和研究奠定基礎(chǔ)。采用RACE技術(shù)克隆獲得魁蚶錳超氧化物歧化酶（MnSOD）基因全長cDNA序列，命名為SbMnSOD。序列結(jié)構(gòu)分析表明：SbMnSOD基因cDNA全長1003bp，I上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文5’-和3’-非編碼區(qū)（UTR）分別為32bp、275bp；開放閱讀框長696bp，編碼一個由232個氨基酸組成的多肽，預(yù)測的蛋白分子量為25
