蘋果和梨AFS基因啟動子的克隆、序列比對及功能分析

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1、園藝學(xué)報,2015,42(12):2353–2361.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0554;http://www.ahs.ac.cn2353蘋果和梨AFS基因啟動子的克隆、序列比對及功能分析1,*2,*111,**鄧帥,成妮妮,丁瑞瑞,劉宇,張元湖12(山東農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,作物生物學(xué)國家重點實驗室,山東泰安271018;臨沂大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山東臨沂276000)摘要:蘋果(Malus×domesticaL.)和梨(PyruscommunisL

2、.)果實在低溫儲存過程中虎皮病的發(fā)生與果皮中受乙烯誘導(dǎo)的α–法尼烯合酶基因(AFS)的表達及α–法尼烯的積累密切相關(guān)。采用TAIL-PCR技術(shù)分別從‘富士’蘋果和‘豐產(chǎn)’梨中克隆到了約2kb的α–法尼烯合酶基因(AFS)啟動子序列,并提交至GenBank中(登錄號分別為KM676083和KM676082)。序列比對發(fā)現(xiàn)兩啟動子同源性僅為48.31%,遠低于其下游編碼區(qū)97%的相似度。順式作用元件在線預(yù)測分析發(fā)現(xiàn)二者同時存在乙烯、脫落酸、茉莉酸、水楊酸等激素響應(yīng)元件,低溫、厭氧、病原菌等脅迫響應(yīng)元件,以及3個節(jié)律性表達元件和2個誘導(dǎo)子響應(yīng)

3、元件。對‘豐產(chǎn)’梨中AFS基因表達模式的分析也證實了部分預(yù)測的誘導(dǎo)因素對其表達有調(diào)控作用。將‘豐產(chǎn)’梨AFS基因啟動子序列進行系列刪除,與GUS報告基因構(gòu)建融合表達載體轉(zhuǎn)化煙草,利用GUS染色方法分析了不同長度啟動子的轉(zhuǎn)錄活性差異,發(fā)現(xiàn)縮短至153bp的啟動子片段仍具有較強的轉(zhuǎn)錄活性,且長度在276bp至573bp的啟動子片段其驅(qū)動下游基因轉(zhuǎn)錄的活性較其他片段更強。通過后續(xù)對各作用元件尤其是乙烯響應(yīng)元件的研究將有助于進一步從分子水平認識虎皮病的發(fā)生機制。關(guān)鍵詞:蘋果;梨;AFS;啟動子;順式作用元件;虎皮病中圖分類號:S661文獻標(biāo)志碼

4、:A文章編號:0513-353X(2015)12-2353-09Cloning,SequenceAlignmentandFunctionalAnalysisofAFSGenePromoterinAppleandPearFruits1,*2,*111,**DENGShuai,CHENGNi-ni,DINGRui-rui,LIUYu,andZHANGYuan-hu1(StateKeyLaboratoryofCropBiology,CollegeofLifeSciences,ShandongAgriculturalUniversity,Tai

5、’an,Shandong2271018,China;CollegeofLifeSciences,LinyiUniversity,Linyi,Shandong276000,China)Abstract:Bothapple(Malus×domesticaL.)andpear(PyruscommunisL.)fruitsarepronetosuffersuperficialscaldduringstorageatlowtemperature.Previousstudieshaveprovedthattheoccurrenceofsuperfi

6、cialscaldiscloselyrelatedtotheα-farnesenesynthasegene(AFS)expressionandaccumulationofα-farneseneinthefruitpeel,butlittleisknownaboutitspromoter.ByusingTAIL-PCRweclonedapproximately2kblengthpromotersequenceofAFSgenefrom‘Fuji’appleand‘Fertility’pear收稿日期:2015–08–19;修回日期:201

7、5–12–16基金項目:國家自然科學(xué)基金項目(31170255)*同等貢獻作者**通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:yhzhang9@163.com)DengShuai,ChengNi-ni,DingRui-rui,LiuYu,ZhangYuan-hu.Cloning,sequencealignmentandfunctionalanalysisofAFSgenepromoterinappleandpearfruits.2354ActaHorticulturaeSinica,2015,42(12):23

8、53–2361.respectivelyandsubmittedthemtoGenBank(Accessionnumber:KM676083andKM676082).Thesequencealignment

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