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《基因組研究鳥(niǎo)獸學(xué)會(huì)華大基因樊偉》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫(kù)。
1、基因組研究樊偉，F(xiàn)anWeifanw@genomics.org.cnTel:13510143870September27,2010Outline基因組研究與測(cè)序技術(shù)發(fā)展回顧華大基因(BGI)介紹Denovo測(cè)序與物種研究Re-sequencing與群體研究性狀基因定位與分子育種轉(zhuǎn)錄組、甲基化測(cè)序與基因調(diào)控研究Meta測(cè)序于共生微生物研究2二十世紀(jì)孕育了“基因世紀(jì)”GenomicEra人類(lèi)基因組計(jì)劃奠定了—“基因組時(shí)代”的基石“基因組時(shí)代”“人類(lèi)基因組計(jì)劃”基因組學(xué)發(fā)展的源動(dòng)力：測(cè)序技術(shù) 三代測(cè)序技術(shù)比較測(cè)序技術(shù)測(cè)序原理代表測(cè)序儀器上市時(shí)間Read讀長(zhǎng)(bp)測(cè)序速度及成本（人基因
2、組）第一代Sanger測(cè)序法：PCR+電泳AB37301981年500花30億美元，用10年時(shí)間第二代邊合成邊測(cè)序，clone擴(kuò)增illuminaGA2007年100花1萬(wàn)美元，用1個(gè)星期第三代單分子(DNA聚合、鉆納米孔)PacBio2011年初(預(yù)計(jì))1000預(yù)計(jì)大規(guī)模應(yīng)用還需三年時(shí)間Sangersequencingtechnology自動(dòng)熒光垂直板凝膠電泳測(cè)序儀代表：ABI公司377型垂直板自動(dòng)測(cè)序儀96個(gè)泳道讀長(zhǎng)高達(dá)700-800bp日分析能力達(dá)300個(gè)樣品熒光檢測(cè)探頭Dr.FredSangerilluminaGenomeAnalyzer當(dāng)前最受矚目的單分子測(cè)序技術(shù)，將于
3、2011年初上市。DNAlevelNetworkRNAlevelImprovehealthanddesignbettercropsgenome/genesequencewholegenomesequencingBAC/fosmid/plasmidPCRcandidateregionsequencinggenome/genevariationwholegenomeresequencingCNVs,SNPsidentifying,genotypingcandidateregionresequencingGenestoNetworkProtein-DNAChIPonSequencing
4、LinknetworkinabackgroundoforganismMetagenomicssequencingsequencing&sequencingDNAmethylation,StudygeneregulationmRNA,ncRNA,smallRNA,microRNA,regulatoryRNAGeneexpressionFindgeneswholetranscriptomshotgunApplicationsthroughSequencing+BioinformaticsOutline基因組研究與測(cè)序技術(shù)發(fā)展回顧華大基因(BGI)介紹Denovo測(cè)序與物種研究Re-s
5、equencing與群體研究性狀基因定位與分子育種轉(zhuǎn)錄組、甲基化測(cè)序與基因調(diào)控研究Meta測(cè)序于共生微生物研究10華大基因(BeijingGenomicsInstitute)華夏生驕子共奠科學(xué)千秋基業(yè)大國(guó)有精英同解生命萬(wàn)世因原--名字闡釋華大基因，創(chuàng)建于1999年，是人類(lèi)基因組計(jì)劃1%中國(guó)卷的主要承擔(dān)者?，F(xiàn)已發(fā)展成為世界最大的DNA測(cè)序和基因組學(xué)研究機(jī)構(gòu),并且初步建成了高通量的蛋白質(zhì)測(cè)序和轉(zhuǎn)基因技術(shù)平臺(tái)。1999,BGI-Beijing2001,BGI-Hangzhou2007,BGI-Shenzhen2009,BGI-Hongkong2010,BGI-Wuhan2010,BGI
6、-Boston2010,BGI-Copenhagen2228Illumina/GAIIx137IlluminaHi-Seq200(2010)2LifeTech/SOLiD4+25LifeTech/SOLiD4(2010)16AB/3730xl+110MegeBACEs2IlluminaiScan(2010)BGIcurrentsequencingcapacity（硬件資源）Dataproduction:100Gb/day(2009)~5Tb/day(endof2010)BGIsupercomputing（硬件資源）#CPUSFlopsRAMStorage2009.011,5001
7、8T4TB2PB2009.083,00050T10TB5PB2009.125,000100T20TB10PB2010.0950,0001,000T(1P)200TB1,000PB(1EB)2008-2010華大近年來(lái)主要科學(xué)成果BGI-PremierScientificPartner高通量測(cè)序平臺(tái)基因分型平臺(tái)生物信息分析中心云計(jì)算平臺(tái)（基因組數(shù)據(jù)庫(kù)）經(jīng)驗(yàn)豐富的基因組研究團(tuán)隊(duì)Outline基因組研究與測(cè)序技術(shù)發(fā)展回顧華大基因(BGI)介紹Denovo測(cè)序與物種研究Re-sequen
