基因組的結(jié)構(gòu)和功能2

基因組的結(jié)構(gòu)和功能2

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1、第三章基因組的結(jié)構(gòu)和功能基因(gene)是核酸的中貯存遺傳信息的遺傳單位,是貯存有功能的蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA序列信息及表達這些信息所必需的全部核苷酸序列(P27)。從生化學上來說指的是一段DNA或RNA(病毒)順序,該順序可以產(chǎn)生或影響某種表型,可以由于突變生成等位基因變異體。從遺傳學上來說代表1個遺傳單位、1個功能單位、1個交換單位或1個突變單位。表型和基因型某一機體可以觀察到的特征稱為表型(phenotype),與表型相應的基因組成稱為基因型(genotype)。如細菌能否合成亮氨酸記為Leu+和Leu-,相應的基因型為Leu+和Leu-。等位基因(1)二倍體細胞有

2、2套基因,一套來自父本,另一套來自母本,每個細胞的全部基因均由2套基因組成,每一對基因稱做等位基因。(2)由于突變作用引起DNA結(jié)構(gòu)變異,所以某一基因可具有若干種不同的形式,這種同一基因不同的形式互稱等信基因(allele)?;虻幕窘Y(jié)構(gòu)5’、、、AGCCGACTATGTCGAAGCTT、、、、、、GCTTGACTATAAGACA、、、3’3‘、、、TCGGCTGATACAGCTTCTAA、、、、、、CGAACTGATATTCTGT、、、5‘轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)貯存RNA或蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息區(qū)轉(zhuǎn)錄終止區(qū)基因組(gencme)細胞或生物中,一套完整單倍體遺傳特質(zhì)的總和(包括一種生物所

3、需的全套基因及間隔序列)稱為基因組(P27)?;蚪M的結(jié)構(gòu)主要指不同的基因功能區(qū)域在核酸分列中的分布和排布情況,基因組的功能是貯存和表達遺傳信息。人類基因組包含多染色體和XY兩條性染色體上的全部遺傳物質(zhì)(核基因組)以及胞線粒體上的遺傳物質(zhì)(線粒體基因組)。(X免疫基因,男XY,女XX)。*1個配對(精子或卵子),1個單倍體細胞或1個病毒所包含的全套基因,稱為基因組。第一節(jié)原核基因組Prokaryoticgenome以細菌為代表講述,有稱bacteriagenome。細菌對醫(yī)學分子生物學有重要貢獻,是基因工程研究的主要材料之一。因為:1.構(gòu)造相對簡單,基因結(jié)構(gòu)也不復雜,取

4、材便利,易于培養(yǎng),可選擇突變株進行研究,實驗結(jié)果容易重復。(如選擇DDDPI缺乏的Ecoli突變株,Ecoli仍可合成DNA,說明酸I對EcoliDNA合成不起作用。)2.與人類有共同的要子生物學規(guī)律可,如:(1)遺傳物質(zhì)都是DNA;(2)主要的功能分子都是蛋白質(zhì);(3)基因密碼是通用的,等等。3.尤其是E.coli,是分子克隆是“明星“,基因工程主要原因的工程菌,因為基因工程的主要工作是克隆克核基因在原核系統(tǒng)中表達。一、原核生物基因組結(jié)構(gòu)與功能的特點1.基因組通常僅由一條環(huán)狀雙鏈DNA分子組成。其DNA是與蛋白質(zhì)結(jié)合,但并不形成染色體結(jié)構(gòu),只是習慣上將之稱為染色體。細

5、菌染色體DNA在胞內(nèi)形成一個致密區(qū)域,即類核(nucleoid),類核無核膜將之與胞漿分開。2.基因組中只有1個復制起點。3.具有操縱子結(jié)構(gòu)。操縱子(operon)是指數(shù)個功能相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,構(gòu)成信息區(qū),連同其上游的調(diào)控區(qū)(包括啟動和操縱區(qū))及其下游的轉(zhuǎn)錄終止信號構(gòu)成的基因表達單位。(見第六章)4.結(jié)構(gòu)基因無重疊現(xiàn)象,基因組中任何一段DNA不會用于編碼2種蛋白質(zhì)。5.基因序列是連續(xù)的,無內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。6.編碼區(qū)和非編碼區(qū)(主要是調(diào)控序列)在基因組中約各占50%。(5%,95%)7.基因組中的重復序列很少。編碼蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)基因多為單拷貝,但編碼rRNA的基因往往是多

6、拷貝的,這有利于核糖體的快速組裝。(15AA/秒,2AA/秒)8.具有編碼同功酶的基因(isogene)這是一類結(jié)構(gòu)不完全相同,而功能相同的基因。如E.coli含有2個編碼乙酸乳酸合成酶的基因和2個編碼分支酸變位酶同工酶的基因。9.細菌基因組中存在可移動的DNA序列,包括插入序列和轉(zhuǎn)座子。10.原核基因的基本結(jié)構(gòu)特點:啟動子(promoter)、操縱基因(operator)、調(diào)控序列、結(jié)構(gòu)基因(structuregene)、終止子(terminator)。(見第六章)二、染色體外的遺傳物質(zhì)———質(zhì)粒(一)概念1.質(zhì)粒(plasmid)是獨立于許多細菌及某些真核細胞染色體

7、外共價閉合環(huán)狀的DNA分子(covalantclosedcircnlar,cccDNA),能獨立復制的最小遺傳單位。(P35-6)2.質(zhì)粒是雙鏈的DNA分子,大小在1—200kb之間,和病毒不同,它們沒有衣殼蛋白(裸DNA)。從生化學來說,除酵母的殺傷質(zhì)粒(killerplasmid)是RNA外,其余質(zhì)粒是染色體外的cccDNA分子。從遺傳學來說,質(zhì)粒是與宿主染色體有別的復制子(真核細胞分裂過程中,DNA纖維分成許多復制單位,該單位稱為復制子)。在細胞分裂時能恒定傳遞給交代細胞的獨立遺傳因子或能在胞內(nèi)寄生和復制的復制子。3.質(zhì)粒與宿主細胞

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