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《黃黑籽甘藍(lán)型油菜類(lèi)黃酮途徑基因snp位點(diǎn)檢測(cè)分析》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線(xiàn)閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、作物學(xué)報(bào)ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(11):1914?1924http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.01914黃黑籽甘藍(lán)型油菜類(lèi)黃酮途徑基因SNP位點(diǎn)檢測(cè)分析1,??1,??1121曲存民盧坤劉水燕卜海東付福友王瑞11,*徐新福李加納12西南大學(xué)重慶市油菜工程技術(shù)研究中心,重慶400716;Agricu
2、ltureandAgri-FoodCanada,SaskatoonResearchCentre,107SciencePlace,S7N02X,SaskatoonSaskatchewan,Canada摘要:類(lèi)黃酮物質(zhì)在植物花、葉、果實(shí)和種子顏色變化的過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用,本研究以不同黃黑籽種皮材料為研究對(duì)象,采用基因同源克隆方法,獲得17個(gè)類(lèi)黃酮基因全長(zhǎng)ORF序列,在核酸和蛋白水平上分別序列差異比較表明,這些基因在不同黃黑籽材料中共存在41個(gè)不同拷貝成員。在核苷酸水平上,檢測(cè)到BnTT3、BnTT18、Bn
3、TTG1和BnTTG2的單核苷酸位點(diǎn)數(shù)目介于16~52之間,且BnTTG2在3個(gè)不同的位置上還存在多個(gè)堿基的連續(xù)性缺失現(xiàn)象(119~121bp、183~189bp和325~330bp),但在蛋白水平上僅存在2~16個(gè)氨基酸位點(diǎn)差異,說(shuō)明BnTT3、BnTT18、BnTTG1和BnTTG2在不同甘藍(lán)型黃黑籽材料中存在單核苷酸位點(diǎn)差異,而單核苷酸位點(diǎn)突變不一定導(dǎo)致氨基酸位點(diǎn)的變異。在不同黃黑籽材料中僅BnTT3和BnTT18存在一致性的氨基酸突變位點(diǎn)(252和87),推測(cè)BnTT3和BnTT18可能在黃黑籽甘藍(lán)型
4、油菜種皮顏色差異形成過(guò)程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。通過(guò)這些位點(diǎn)的等位特異PCR可以區(qū)分材料間透明種皮基因,為特異基因芯片的開(kāi)發(fā)及闡明甘藍(lán)型油菜種皮色澤性狀的基因及其作用位點(diǎn)奠定基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞:甘藍(lán)型油菜;類(lèi)黃酮途徑;單核苷酸位點(diǎn)多態(tài)性;黃黑籽;透明種皮基因SNPDetectionandAnalysisofGenesforFlavonoidPathwayinYellow-andBlack-SeededBrassicanapusL.1,??1,??11211QUCun-Min,LUKun,LIUShui-Yan,BUH
5、ai-Dong,FUFu-You,WANGRui,XUXin-Fu,andLI1,*Jia-Na12ChongqingRapeseedTechnologyResearchCenterofSouthwestUniversity,Chongqing400716,China;AgricultureandAgri-FoodCanada,SaskatoonResearchCentre,107SciencePlace,S7N02X,SaskatoonSaskatchewan,CanadaAbstract:Flavonoi
6、dsasthesecondarymetabolitesplayacrucialroleincolourchangingprocessofflower,leaf,fruitandseed.Inthisresearch,primersforamplifyingfull-lengthORFsequencesofthegenesinvolvedinthefavonoidbiosynthesispathwaysweredesignedaccordingtoconservednucleotideregionsfromth
7、epublicdatabases.Usingthehomology-basedcloningstrategy,41genecopieswereobtainedfrom13genesusing17pairsofspecificprimersindifferentyellow-andblack-seededseedcoatsofB.napus.Eachoffull-lengthORFsequenceswassequencedandanalyzedinthelevelsofbothnucleicacidandpro
8、tein.TheresultsshowedthattheSNPsinfourflavonoidpathwaygenes(BnTT3,BnTT18,BnTTG1,andBnTTG2),rangedfrom16to52,buttherewereolny2to16aminoacidmutationsdetectedintheproteinlevel,indicatingthatthemutationofS
