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《棉花基于轉(zhuǎn)錄組和vigs分析的抗黃萎病通路解析和抗病相關(guān)基因發(fā)掘》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在教育資源-天天文庫。
1、棉花基于轉(zhuǎn)錄組和VIGS分析的抗黃萎病通路解析和抗病相關(guān)基因發(fā)掘1、相關(guān)定義1.1、糖苷類化合物定義、分布和分類糖苷(glycoside)亦稱配糖體、苷或糖甙,由糖或糖的衍生物與另一非糖物質(zhì)通過其端基碳原子聯(lián)接而成的化合物。非糖物質(zhì)即為甙元,又稱苷元(aglycone)或者配基(genin),分子內(nèi)連接糖和非糖部分的化學(xué)鍵即所謂的苷鍵,因為糖存在α與β兩類不同的差向異構(gòu)體,因此存在α苷和β苷的區(qū)別。糖的部分是苷的共性部分,但因苷元涵蓋了基本各種類型的天然成分和(或)人工合成成分,因此在結(jié)構(gòu)類型上存在巨大的差別,性質(zhì)也不相同[82]。不同種類的天然藥物及植
2、物中的糖苷類物質(zhì)差異非常大,即便在同種天然藥物和植物里,也會由于配基相同但相連的糖的種類、數(shù)量的不一樣或者是糖的數(shù)量、種類相同但配基不一樣使得糖苷差別很大。糖苷在生物體中存在廣泛,在許多擔(dān)負重要的生物學(xué)功能和具有獨特良好生物學(xué)活性的植物的根、花、葉、皮和籽中發(fā)揮了重要作用。很多植物糖苷味苦、有毒,可避免動物對其侵食,以保護自身的生命安全。大多數(shù)的糖苷化合物被糖苷酶分解后,可生成消毒劑(例如苯酚)或者某些毒性物質(zhì)(例如氫氰酸),如果植物遭遇到破壞;可借以保護被破壞的部分,以防病原體對其侵害。植物的籽粒里存在有扁桃苷可分解成氫氰酸,樹皮內(nèi)存在有苯酚糖苷可分解
3、成苯酚。糖苷也具備儲糖作用,尤其籽粒內(nèi),生長到特定的時期可隨著需要來釋放[82]。很多植物14體花瓣以及果實顯示的紅、綠和紫色等,大都是因為其植物色素的花色苷作用的結(jié)果[83]。在動物機體中也有糖苷的存在,比如腦組織中的腦苷、神經(jīng)組織中的神經(jīng)苷脂、尿中的尿苷等。糖苷類化合物在糖和衍生物中占有不可替代的地位,并且存在于眾多中草藥的生物活性成分中,因此對糖苷類化合物的研究越來越多[84-86]。糖苷根據(jù)糖的組成,可分為糖勻體和糖雜體。糖勻體是均由糖組成的物質(zhì):如單糖、低聚糖、多糖等,可分為常見單糖、氨基糖、糖醇、去氧糖和糖醛酸。糖雜體是由糖與非糖組成的化合物
4、,按苷原子不同分為氧苷、氮苷、硫苷和碳苷;按苷元不同分為黃酮苷、蒽苷、香豆素、強心苷和皂苷等;按苷鍵不同分為醇苷、酚苷、酯苷和氰苷;按端基碳構(gòu)型分α苷和β苷;按連接單糖個數(shù)分單糖苷、雙糖苷和三糖苷;按糖鏈個數(shù)分單糖鏈和雙糖類;按生物體內(nèi)存在分原級苷和次級苷。1.2、SSR標(biāo)記的定義及搜索U冊丨核心丨丨’二列小r10個核r「峻的;1_
5、聯(lián)小」J.:1乂■”]’被稱為微i.v。.微
6、14杭州師范人‘貞位論文星是真核基因組屮中.富的多態(tài)性原件,突變率高,是由于DNA復(fù)制時聚合酶滑動y??致鏈錯配而形成
7、83_85
8、。搜索微utniktnik/index.htm
9、l.P.里的主要程序而’Sp(http://abaiian.net/spu),是-.個C語言程序,其計算方法是遞歸算法,能搜索2-5個核心序列的SSR;程序MlcroSAtelliteidentificationtool(http://pgrc.ipk-uatersleben.de/misa/misa.html)Mtb搜索嚴(yán)格的微衛(wèi)星序列,+可避免的會丟失-?些發(fā)生突變或缺失的微衛(wèi)星;RepeatMasker(http://www.repeatmasker.org/)只能用于搜索2-6個堿基重復(fù)的微衛(wèi)星,對其它堿基的微衛(wèi)星不起作用;軟件SSRLocato
10、r:http://www.urpel.tche.br/laem/fitotecnia/fitomelhoramento/faleconosco.html,不僅可在DNA序列中搜索和描述SSR,而且n丨用于弓丨物設(shè)計和模擬PCR反應(yīng)。3.2SSR標(biāo)記在R.solani中的應(yīng)用由于測序技術(shù)的迅速發(fā)展,微衛(wèi)星標(biāo)記在立枯絲核菌屮被廣+泛地應(yīng)用。Banniza等[861用SSR-PCR研究了R.,?>/訓(xùn)/AG-1-IA的丨1]間菌株,獲得了SSR-PCR閣譜,通過類平均法(UPGMA)聚類分析。雖然引物MR和GF聚類分析的結(jié)來相同,但是表型卻完全不丨司,表明a.
11、solani的田間菌株存在很1?的多態(tài)性。ZALA等從感染水稻和玉米的AG-l-IA基因組中分離出了10個多態(tài)性的微衛(wèi)M,顯示來丨4于美國路易斯安那州和委內(nèi)瑞拉的2個種群中,所有微衛(wèi)星位點均?出了多態(tài)性且每個位點的等位基因數(shù)4-8個不等。利用這10個微衛(wèi)星位點對來D于巴西和美同感染AG-1的大豆進行基因分型,位點TC06擴增長度不同,顯出種特的重復(fù)長度多態(tài)性。Assis等利用10個微衛(wèi)』ft比較了路場斯安那州感染水稻和人豆的AG-1-IA群體和來丨‘:丨J-Texas感染水稻的AG-1-IA群體,顯示223個菌株中,發(fā)現(xiàn)154個多等位基W位點,然而這15
12、4個多等位基W位點在H個利I群間并yf供享;同_-地K利Hj寄:來源的群體之制遺
