trizol法提取rna實(shí)驗(yàn)步驟

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1、Trizol法使用步驟一、分離純化的基本原理研究基因的表達(dá)和調(diào)控時(shí)常常要從組織和細(xì)胞中分離和純化RNA。RNA質(zhì)量的高低常常影響cDNA庫(kù),RT-PCR和NorthernBlot等分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的成敗。Trizol是一種新型總RNA抽提試劑,內(nèi)含異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細(xì)胞,抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶。二、用戶(hù)需自備的試劑和材料無(wú)水乙醇、氯仿、Glycogen(可能需要)、1.5mlEppendorf管(RNase-free)、Tips(RNase-free)三、準(zhǔn)備工作RNase酶非常穩(wěn)定,是導(dǎo)致RNA降解最主要的

2、物質(zhì)。它在一些極端的條件可以暫時(shí)失活,但限制因素去除后有迅速?gòu)?fù)性。用常規(guī)的高溫高壓蒸氣滅菌方法和蛋白抑制劑都不能是RNase完全失活。它廣泛存在于人的皮膚上,因此,在與RNA制備有關(guān)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)時(shí),必須戴手套。RNase的又一污染源是取液器,根據(jù)取液器制造商的要求對(duì)取液器進(jìn)行處理。一般情況下采用用DEPC配制的70%乙醇擦洗取液器的內(nèi)部和外部,基本達(dá)到要求。取RNase-free的物品時(shí)必須戴手套。1、料制品的處理盡可能使用無(wú)菌,一次性塑料制品,已標(biāo)明RNase-Free的塑料制品,如沒(méi)有開(kāi)封使用過(guò)通常沒(méi)有必要再

3、次處理。對(duì)于國(guó)產(chǎn)塑料制品,原則上都必須處理方可使用。處理步驟如下:1)在玻璃燒杯中注入去離子水,加入DEPC使DEPC的終濃度為0.1%。注意:DEPC為劇毒物,活性很強(qiáng),小心在通風(fēng)柜中使用。2)處理的塑料制品放入一個(gè)可以高溫滅菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。3)在通風(fēng)柜中室溫處理過(guò)夜。4)將DEPC水溶液小心倒到廢液瓶中,用鋁箔封住含已DEPC水處理過(guò)的塑料制品的燒杯,高溫高壓蒸氣滅菌至少30分鐘。5)烘箱用合適的溫度烘拷至干燥。置于干凈處備用。2、璃玻和金屬物品250°C烘烤3

4、小時(shí)以上。四、從組織中提取總RNA1)液氮研磨:組織塊直接放入研缽中,加入少量液氮,迅速研磨,待組織變軟,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg組織/mlTrizol加入Trizol,轉(zhuǎn)入離心管進(jìn)行第2步操作。2)勻漿:組織樣品按50-100mg/mlTrizol加入Trizol。另外,組織體積不能超過(guò)Trizol體積的10%,否則勻漿效果會(huì)不好,用電動(dòng)勻漿器充分勻漿約需1-2分鐘。五、從細(xì)胞中提取總RNA1)培養(yǎng)貼壁細(xì)胞:不須消化,可直接用Trizol進(jìn)行消化、裂解,Trizol體積按10cm2/ml比

5、例加入。2)懸浮細(xì)胞可直接收集、裂解,每1mlTrizol可裂解5×106動(dòng)物、植物或酵母細(xì)胞,或107細(xì)菌細(xì)胞。六、操作步驟1、細(xì)胞或組織加Trizol后,室溫放置5min,使其充分裂解。注:此時(shí)可放入-70℃長(zhǎng)期保持。2、12,000rpm離心5min,棄沉淀。3、按200ul氯仿/mlTrizol加入氯仿,振蕩混勻后室溫放置15min。注:禁用漩渦振蕩器,以免基因組DNA斷裂。4、4℃12,000g離心15min。5、吸取上層水相,至另一離心管中。注:千萬(wàn)不要吸取中間界面;若同時(shí)提取DNA和蛋白質(zhì),則保留下層酚

6、相存于4℃冰箱,若只提RNA,則棄下層酚相。6、按0.5ml異丙醇/mlTrizol加入異丙醇混勻,室溫放置5-10min。7、4℃12,000g離心10min,棄上清,RNA沉于管底。8、按1ml75%乙醇/mlTrizol加入75%乙醇,溫和振蕩離心管,懸浮沉淀。9、4℃8,000g離心5min,盡量棄上清。10、室溫晾干或真空干燥5-10min。注:RNA樣品不要過(guò)于干燥,否則很難溶解。11、可用50ulH2O,TEbuffer或0.5%SDS溶解RNA樣品,55-60℃,5-10min。注:H2O、TE或0.

7、5%SDS均須用DEPC處理并高壓。12、測(cè)O.D值定量RNA濃度。注:此方法提取RNAA260/A280值在1.6-1.8之間;產(chǎn)率估計(jì):組織標(biāo)本:(ugRNA/mg組織)1-10ug,培養(yǎng)細(xì)胞(ugRNA/106Cell):5-15ug。注:組織或細(xì)胞量過(guò)少,可酌情減少Trizol用量;組織或細(xì)胞用量過(guò)多,會(huì)引起DNA對(duì)RNA的污染;高蛋白、脂肪或多糖類(lèi)組織,肌肉組織或塊狀植物組織等,組織勻漿或液氮研磨后須4℃12,000g離心10min去掉不溶物,再進(jìn)行下面操作,若頂層有脂肪物,則也須去掉;熱天提RNA,帶手套

8、是必須的,手是RNase的主要來(lái)源;組織塊用液氮研磨,效果最好,若沒(méi)有液氮或電動(dòng)勻漿器,可用手動(dòng)勻漿器代替,此時(shí)組織塊不宜過(guò)大,且需先用眼科剪刀將組織堿堿剪碎,然后再充分研磨。6.1.2.1肝臟、腸道、肌肉總RNA提取方法①使用已高溫蒸汽滅菌的手術(shù)刀和鑷子從魚(yú)的腹部解剖開(kāi),從中取出完整的肝臟、腸、肌肉等組織,置于離心管后立即放入液氮中;②組織在

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