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《trizol法提取RNA》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、植物總RNA的提取抽提RNA所用的研缽酒精灼燒5-10min.,其他器皿均用0.1%的DEPC水處理,24hr.后高溫高壓滅菌兩次,以去除RNA酶,所有試劑都保證沒有RNA酶污染。1)1.5ml離心管中加入1mlTrizol,取0.1g組織在液氮中研磨至粉末,加入到Trizol中,立即充分混勻。2)將混勻的組織在15-30℃放10min,使核酸蛋白復(fù)合體物完全分離。3)4℃,10000rpm離心20min,取上清。4)加氯仿200μl,5MNaCl200μl,劇烈振蕩15s,室溫放置3min(或
2、不放置,直接離心)。5)4℃,10000rpm離心20min,樣品會分成3層,取上層水相,取上清。176)加500μl異丙醇,混勻,室溫放置10min。7)4℃,10000rpm離心15min,去上清,管底管側(cè)形成膠狀沉淀。8)加1ml75%乙醇,洗滌沉淀,重復(fù)兩次,洗滌用4℃,7500rpm離心5min,棄上清。9)吹干約15min。10)加50μlDEPC處理的水,65℃溶解,-20℃(最好-80℃)保存。DNaseI處理消化植物總RNA中的基因組DNA1)取5μl的植物總RNA,然后順序加
3、入1μl10×緩沖液,1μlDNase,3μlRNase-free水,總體積10μl,充分混勻后,37℃溫育30min。2)加入1μl終止緩沖液,65℃溫育10min,使DNase失活。反轉(zhuǎn)錄cDNA1)在上述總體積為11μl反應(yīng)液中加入1μlOligo(dT)18引物4μl5×緩沖液,2μldNTP,1μl反轉(zhuǎn)錄酶,1μlRNase抑制劑,總體積20μl,充分混勻后,42℃溫育1-1.5hr。2)70℃溫育10min,終止反應(yīng)trizol法提取RNA步驟2010年03月09日星期二17:07從
4、組織中提取總RNA1)液氮研磨,組織塊直接放入研體中,加入少量液氮,迅速研磨,待組織變軟,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg組織/mlTrizol加入Trizol,轉(zhuǎn)移入離心管進(jìn)行第2步操作。2)勻漿:組織樣品按50-100mg/mlTrizol加入Trizol,另外,組織體積不能超過Trizol體積的10%,否則勻漿效果會不好,用電動勻漿器充分勻漿約需1-2分鐘。從細(xì)胞中提取總RNA1)培養(yǎng)貼壁細(xì)胞:不須消化,可直接用Trizol進(jìn)行消化、裂解,Trizol體積按10cm2/m
5、l比例加入。2)懸浮細(xì)胞可直接收集、裂解,每1mlTrizol可裂解5×106動物、植物或酵母細(xì)胞,或107細(xì)菌細(xì)胞。2.細(xì)胞或組織加Trizol后,室溫放置5min,使其充分裂解。注:此時可放入-70℃長期保持。3.12000rpm離心5min,棄沉淀。4.按200ul氯仿/mlTrizol加入氯仿,振蕩混勻15分鐘,室溫放置15min。注:禁用漩渦振蕩器,以免基因組DNA斷裂。5.4℃12000g離心15min。6.吸取上層水相,至另一離心管中。注:1)千萬不要吸取中間界面。2)若同時提取D
6、NA和蛋白質(zhì),則保留下層酚相存于4℃冰箱,若只提RNA,則棄下層酚相。7.按0.5ml異丙醇/mlTrizol加入異丙醇混勻,室溫放置5-10min。8.4℃12000g離心10min,棄上清,RNA沉于管底。9.按1ml75%乙醇/mlTrizol加入75%乙醇,溫和振蕩離心管,懸浮沉淀。10.4℃8000g離心5min,盡量棄上清。11.室溫晾干或真空干燥5-10min。注:RNA樣品不要過于干燥,否則很難溶解。12.可用50ulH2O,TEbuffer或0.5%SDS溶解RNA樣品,55-
7、60℃5-10min。注:H2O、TE或0.5%SDS均須用DEPC處理并高壓。12、測O.D值定量DNA濃度。注:1)此方法提取RNAA260/A280值在1.6-1.8之間。2)產(chǎn)率估計:組織標(biāo)本:(ugRNA/mg組織)1-10ug,培養(yǎng)細(xì)胞(ugRNA/106Cell):5-15ug。注:1、組織或細(xì)胞量過少,可酌情減少Trizol用量。2、組織或細(xì)胞用量過多,會引起DNA對RNA的污染。3、高蛋白,脂肪或多糖類組織,肌肉組織或塊狀植物組織等,組織勻漿或液氮研磨后須4℃1200離心10m
8、in去掉不溶物,再進(jìn)行下面操作,若頂層有脂肪物,則也須去掉。4、熱天提RNA,帶手套是必須的,手是RNase的主要來源。5、組織塊用液氮研磨,效果最好,若沒有液氮或電動勻漿器,可用手動勻漿器代替,此時組織塊不宜過大,且需先用眼科剪將組織絞碎,然后再充分研磨。植物總RNA提取-Trizol法 Trizol法適用于人類、動物、植物、微生物的組織或培養(yǎng)細(xì)菌,樣品量從幾十毫克至幾克。用Trizol法提取的總RNA絕無蛋白和DNA污染。RNA可直接用于Northern斑點(diǎn)分析,斑點(diǎn)雜交,Poly(A)+