trizol法提取rna實驗步驟及原理(新手詳細注釋版)

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1、Trizol法使用步驟一、分離純化的基本原理研究基因的表達和調(diào)控時常常要從組織和細胞中分離和純化RNA。RNA質(zhì)量的高低常常影響cDNA庫,RT-PCR和NorthernBlot等分子生物學(xué)實驗的成敗。Trizol是一種新型總RNA抽提試劑,內(nèi)含異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細胞,抑制細胞釋放出的核酸酶。二、用戶需自備的試劑和材料無水乙醇、氯仿、Glycogen(可能需要)、1.5mlEppendorf管(RNase-free)、Tips(RNase-free)三、準備工作RNase酶非常穩(wěn)定,是導(dǎo)致RNA降解最主要的物質(zhì)。它在一些極端的條件可以暫時失活,但限制因素去除后有迅速復(fù)性。用

2、常規(guī)的高溫高壓蒸氣滅菌方法和蛋白抑制劑都不能是RNase完全失活。它廣泛存在于人的皮膚上,因此,在與RNA制備有關(guān)的分子生物學(xué)實驗時,必須戴手套。RNase的又一污染源是取液器,根據(jù)取液器制造商的要求對取液器進行處理。一般情況下采用用DEPC(焦炭酸二磷脂,一種RNase抑制劑)配制的70%乙醇擦洗取液器的內(nèi)部和外部,基本達到要求。取RNase-free的物品時必須戴手套。1、料制品的處理盡可能使用無菌,一次性塑料制品,已標明RNase-Free的塑料制品,如沒有開封使用過通常沒有必要再次處理。對于國產(chǎn)塑料制品,原則上都必須處理方可使用。處理步驟如下:1)在玻璃燒杯中注入去離子水,加

3、入DEPC使DEPC的終濃度為0.1%。注意:DEPC為劇毒物,活性很強,小心在通風(fēng)柜中使用。2)處理的塑料制品放入一個可以高溫滅菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。3)在通風(fēng)柜中室溫處理過夜。4)將DEPC水溶液小心倒到廢液瓶中,用鋁箔封住含已DEPC水處理過的塑料制品的燒杯,高溫高壓蒸氣滅菌至少30分鐘。5)烘箱用合適的溫度烘拷至干燥。置于干凈處備用。2、璃玻和金屬物品250°C烘烤3小時以上。四、從組織中提取總RNA1)液氮研磨:組織塊直接放入研缽中,加入少量液氮,迅速研磨,待組織變軟,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg組織/ml

4、Trizol加入Trizol,轉(zhuǎn)入離心管進行第2步操作。(液氮既能使各種組織成分不易被破壞或降解,又能使組織變硬,脆性增加易于磨碎。終止細胞內(nèi)外一切生物反應(yīng),防止RNA酶的降解反應(yīng))2)勻漿:組織樣品按50-100mg/mlTrizol加入Trizol。另外,組織體積不能超過Trizol體積的10%,否則勻漿效果會不好,用電動勻漿器充分勻漿約需1-2分鐘。五、從細胞中提取總RNA1)培養(yǎng)貼壁細胞:不須消化,可直接用Trizol進行消化、裂解,Trizol體積按10cm2/ml比例加入。2)懸浮細胞可直接收集、裂解,每1mlTrizol可裂解5×106動物、植物或酵母細胞,或107細菌

5、細胞。六、操作步驟1、細胞或組織加Trizol后,室溫放置5min,使其充分裂解。注:此時可放入-70℃長期保持。2、12,000rpm離心5min,棄沉淀。3、按200ul氯仿/mlTrizol加入氯仿,振蕩混勻后室溫放置15min。注:禁用漩渦振蕩器,以免基因組DNA斷裂。(氯仿為有機溶劑,有效的使有機相和無機相迅速分離。有機相中主要是酚和蛋白結(jié)合,從而使得蛋白和RNA脫離,RNA進入水相)4、4℃12,000g離心15min。5、吸取上層水相,至另一離心管中。注:千萬不要吸取中間界面;若同時提取DNA和蛋白質(zhì),則保留下層酚相存于4℃冰箱,若只提RNA,則棄下層酚相。6、按0.5

6、ml異丙醇/mlTrizol加入異丙醇(沉淀RNA)混勻,室溫放置5-10min。7、4℃12,000g離心10min,棄上清,RNA沉于管底。8、按1ml75%乙醇/mlTrizol加入75%乙醇(沉淀RNA),溫和振蕩離心管,懸浮沉淀。9、4℃8,000g離心5min,盡量棄上清。10、室溫晾干或真空干燥5-10min。注:RNA樣品不要過于干燥,否則很難溶解。11、可用50ulH2O,TEbuffer或0.5%SDS溶解RNA樣品,55-60℃,5-10min。注:H2O、TE或0.5%SDS均須用DEPC處理并高壓。(TE緩沖液由Tris和EDTA配制而成,主要用于溶解核酸,

7、能穩(wěn)定儲存DNA和RNA。用于酶切反應(yīng)不能使用SDS)12、測O.D值定量RNA濃度。注:此方法提取RNAA260/A280值在1.6-1.8之間;產(chǎn)率估計:組織標本:(ugRNA/mg組織)1-10ug,培養(yǎng)細胞(ugRNA/106Cell):5-15ug。注:組織或細胞量過少,可酌情減少Trizol用量;組織或細胞用量過多,會引起DNA對RNA的污染;高蛋白、脂肪或多糖類組織,肌肉組織或塊狀植物組織等,組織勻漿或液氮研磨后須4℃12,000g離心10m

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