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《櫛孔扇貝chlamysfarrericsnp的開發(fā)及其在單倍型構(gòu)建中的應(yīng)用》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在應(yīng)用文檔-天天文庫。
1、櫛孔扇貝(Chlamys角廠廠e廠，)cSNP的開發(fā)及其在單倍型構(gòu)建中的應(yīng)用學(xué)位論文完成日期：指導(dǎo)教師簽字：答辯委員會(huì)成員簽字：獨(dú)創(chuàng)聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含未獲得(洼i翅遺直基絲霞蔓掛型童盟笪!奎攔互窒2或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名．墨悶抓簽字吼辦lJ年6月2日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校
2、有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，并同意以下事項(xiàng)：l、學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱。2、學(xué)?？梢詫W(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。同時(shí)授權(quán)清華大學(xué)“中國學(xué)術(shù)期刊(光盤版)電子雜志社"用于出版和編入CNKI《中國知識(shí)資源總庫》，授權(quán)中國科學(xué)技術(shù)信息研究所將本學(xué)位論文收錄到《中國學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫》。(保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書)學(xué)讎文儲(chǔ)虢甬貅翮酶、W簽字日期：必If年‘月7--日簽字日期：≯，1年6月1日eofandprobesaredesig
3、nedforcandidatesites．Twohundredandfifty—ninepairsofprimersareampliedsuccessfully,whichtakeaccountfor65．8％ofallthedesigned．Thesizesofproductsbetween70bpsand900bps，andthenprimersofproductsbetween70bpsand150bpsarepicked．Sixindividualsareusedfortestingvalidationofprobes，getting101sitesfor
4、genotypinglater．Consequently，44cSNPs(excludei_add)areidentifiedfollowinghighresolutionmelting(HRM)bytaking48representativeunrelatedindividuals，whichorignatefrom5populations．Forty-eightindividualsfromQingdaopopulationareutilizedforcharactering．Overall,HErangefrom0．100to0．505凰distribute
5、fromO．1042to0．875．Four·ofanalysesexhibitednon-MendeliansegregationratiosbeforeBonferronicorrection，withO．8％significantaftercorrection．demonstratingthatSNPsmarkerscanbeconsideredMendeliantraits．Thereare40lociconformedtoHardy-Weinbergequilibrium，whichareusefulformanystudies．燦1the44locia
6、rebi—alleliclociincluding34transitionand10transversion．TheseresultssuggestthatthetranscriptomeofZhikongscallophasrelativelyhighdegreeofvariation．ThesemarkersarepotentiallyusefulforevaluationofgeneticdiversityandpopulationstructureofZhikongscallop．2．ConstructionofHapIotypeUSingSNPsInth
7、ispart，SNPsareusedtohaplotypeconstruction．Firstly,contigscontainedtypingSNPsareclusteredtoget8blocks，whichareabout376bpsto2359bpsinlengthand972bpsofaveragespace，using48individualsfromQingdaopopulation．EveryblockhavethreeorfourtypingSNPs．BlockC34869CHFandC5273CHFhaveaconcordantsequence
8、lengt
