9.流感病毒的快速檢測(cè)方法

9.流感病毒的快速檢測(cè)方法

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1、流感病毒的快速檢測(cè)方法一、RT-PCR快速診斷方法(一)生物安全要求(二)病毒核酸提取(三)RT-PCR(四)PCR產(chǎn)物純化(五)流感病毒RT-PCR檢測(cè)引物二、免疫熒光方法檢測(cè)流感病毒(一)原理(二)標(biāo)本處理(三)間接免疫熒光法(四)結(jié)果判斷三、實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real-TimePCR)快速診斷檢測(cè)(一)基本原理(二)實(shí)驗(yàn)試劑(三)實(shí)驗(yàn)步驟四、快速診斷試劑盒流感的快速檢測(cè)方法,與傳統(tǒng)的病毒分離鑒定相比具有快速、簡便的特點(diǎn)。因此常用于流感暴發(fā)時(shí)早期病原學(xué)檢測(cè)用。流感的快速診斷包括直接和間接免疫熒光法、ELISA、RT-PCR、Real-TimeP

2、CR快速診斷速方法、流感快速診斷試劑盒等。這里介紹RT-PCR、Real-TimePCR、免疫熒光快速診斷速診斷方法和幾種流感快速診斷試劑盒優(yōu)缺點(diǎn)。無論那種快速診斷都無法代替?zhèn)鹘y(tǒng)的病毒分離鑒定方法。一、RT-PCR快速診斷方法核酸檢測(cè)是一種鑒定流感病毒基因組的有力方法,即使基因組含量很低或死病毒也可以檢測(cè)到。本章將介紹檢測(cè)流感病毒的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)。流感病毒的基因組是負(fù)鏈RNA,在進(jìn)行PCR擴(kuò)增前必須合成與病毒RNA互補(bǔ)的DNA,即為cDNA。逆轉(zhuǎn)錄酶(RT)就是用于合成cDNA的多聚酶,因此,擴(kuò)增流感病毒基因組的過程稱為RT-PCR。RT-

3、PCR需要一對(duì)型別特異引物,四種脫氧核苷酸(dNTPs),RNA模板,逆轉(zhuǎn)錄酶及TaqDNA多聚酶;首先由逆轉(zhuǎn)錄酶將病毒的RNA逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,然后再進(jìn)行聚合酶鏈反應(yīng)經(jīng)25~30個(gè)循環(huán),使DNA產(chǎn)物達(dá)到倍增的效果。(一)生物安全要求生物安全級(jí)別與個(gè)人防護(hù)要求:生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室,防護(hù)要求與二級(jí)實(shí)驗(yàn)室的要求相同。并應(yīng)遵守相應(yīng)的生物安全規(guī)定。進(jìn)行高致病性禽H5RT-PCR快速檢測(cè)時(shí)可以在生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室里進(jìn)行,核酸提取在生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室的生物安全柜里完成。(一)病毒核酸提取1.實(shí)驗(yàn)材料及儀器(1)QIAGEN公司的RneasyMiniKit(Ca

4、talog#74104)(2)β-巰基乙醇(β-mercaptoethanol)(3)70%乙醇(4)無菌1.5ml離心管(5)10μl、20μl、200μl、1000μl加樣器和槍頭(6)可調(diào)14K微型離心機(jī)(7)旋轉(zhuǎn)混合器2.操作步驟(1)取1支無菌、無RNA酶的1.5mlEppendorf管,加入500μlRLT。(2)取采樣液(鼻拭子、咽拭子、胸水等)或病毒培養(yǎng)物(雞胚尿囊液或細(xì)胞培養(yǎng)液)100μl,加入上述Eppendorf管中。(3)加5μlβ-巰基乙醇,充分混勻。(4)加600μl70%乙醇,于旋轉(zhuǎn)混合器混勻。(5)從試劑盒中取出帶濾膜

5、的離心柱,并標(biāo)上標(biāo)本號(hào)。(6)將第4步的混合液體分兩次(每次600μl)吸入于濾柱中,12000rpm離心15秒,棄收集管中的離心液。(7)濾柱仍放回收集管上,將第4步的混合液全部吸入濾柱中,12000rpm離心15秒,棄收集管中液體。(8)于濾柱中加入700μlRW1,12000rpm離心15秒。(9)從試劑盒中取出一支新的2ml收集管,將離心后的濾柱轉(zhuǎn)到新的收集管上,于柱子中加入500μlRPE,12000rpm離心15秒棄收集管中液體。(10)濾柱放回收集管上,于濾柱中加入500μlRPE,13000~14000rpm離心2分鐘。(11)從試劑

6、盒中取出一支1.5mlEppendorf管,將濾柱轉(zhuǎn)到新的1.5ml管上,于濾柱中加入30~50μl無RNA酶的水,室溫靜置1~3分鐘。(12)12000rpm離心1分鐘,棄濾柱。收集的離心液即為提取病毒的RNA,可以直接用于逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),或在-20℃以下保存,-30℃可保存3~4個(gè)月。3.注意事項(xiàng)(1)試劑盒中的RPE液用前需加44ml無水乙醇,使終體積達(dá)到55ml。(2)所有用過的槍頭、收集管放入2%次氯酸鈉消毒缸中過夜。(二)RT-PCR1.一步法RT-PCR(1)實(shí)驗(yàn)材料1)QIAGENOneStepRT-PCRKitCatNo2102122)

7、RNaseinhibitor40u/μl(Promega)3)上游引物200ng/μl4)下游引物200ng/μl1)模板RNA(TempletRNA)(2)實(shí)驗(yàn)步驟1)PCR反應(yīng)配置(在清潔區(qū)緩沖間,加RNA模板應(yīng)在核酸室)無RNA酶水(RnaseFreeWater)28.75μl5×Buffer10μl10mMdNTP2μlEnzymeMix2μlRnaseinhibitor0.25μl上游引物1μl下游引物1μlRNA模板5μl總量:50μl2)將PCR反應(yīng)管放入PCR擴(kuò)增儀3)RT-PCR反應(yīng)條件:此循環(huán)的反應(yīng)條件僅共參考,如果引物更換,相應(yīng)

8、的反應(yīng)條件需要做適當(dāng)調(diào)整。?60℃1min?42℃10min?50℃30min?95℃15min?94℃30

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