戊型肝炎病毒診斷基因芯片制備的初步研究

戊型肝炎病毒診斷基因芯片制備的初步研究

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1、廣東藥學(xué)院學(xué)報JournalofGuangdongPharmaceuticalCollegeJun.2010。26(3)戊型肝炎病毒診斷基因芯片制備的初步研究王治偉,馬文麗,夏薇,楊瓊,鄭文嶺(1.南方醫(yī)科大學(xué)基因工程研究所,廣東廣州510515;2.廣州醫(yī)學(xué)院港灣醫(yī)院檢驗科,廣東廣州510700;3.華南基因組中心,廣東廣州510830)摘要:目的制備戊型肝炎病毒診斷基因芯片并進(jìn)行雜交驗證。方法利用Oligo6.0軟件針對戊型肝炎病毒診斷基因保守區(qū)域設(shè)計多對寡核苷酸探針,用芯片點(diǎn)樣儀將其按照陣列設(shè)計打印在玻片上制備成基因芯片。樣品標(biāo)記采用限制性顯示技術(shù),樣品標(biāo)記后進(jìn)行雜交,進(jìn)而在芯片掃描儀

2、中對得到的探針數(shù)據(jù)進(jìn)行分析并實驗驗證。結(jié)果芯片雜交后得到的探針熒光強(qiáng)度好,信噪比高,符合臨床樣品的基因亞型,RT—PCR驗證后得到的電泳結(jié)果與芯片實驗一致。結(jié)論實驗設(shè)計并制備的寡核苷酸戊型肝炎病毒診斷芯片能用于戊肝的檢測,為這項疾病的實驗室診斷提供了一種快速平行的檢測方法。關(guān)鍵詞:戊型肝炎;基因芯片;診斷中圖分類號:R512.6;Q812文獻(xiàn)標(biāo)識碼:Adoi:10.3969/j.issn.1006—8783.2010.03.025文章編號:1006—8783(2010)03—0314—05PreliminarystudyonpreparationofdiagnosticDNAmicroarr

3、ayforhepatitisEvirusWANGZhiwei,,MAWen.1i,XIAWei,YANGQiong,ZHENGWen.1ing(1.InstituteofGeneticEngineering,SouthernMedicalUniversity,Guangzhou,Guangdong510515,China;2.ClinicalLaboratory,GangwanHospitalofGuangzhouMedicalCollege,Guaagzhou,Guangdong510700,China;3.C.enomeCenterofSouthChina,Guangzhou,Guang

4、dong510830,China)Abstract:ObjectiveTostudythepreparationofdiagnosticDNAmicroarrayforhepatitisEvirus(HEV).MethodsThespecificprimersofoligoprobesweredesignedwiththeOligo6.0programaccordingtotheconservedregionofHEV.TheDNAmicroarrayswerepreparedbyspottingtheprobestothesurfaceofglassslidesbytherobotics.

5、RestrictiondisplayPCRwasusedtolabelthesamples.ResultsTheresultsshowedthattheoligoprobeswerespecifichybridizedwithHEVsamples.Andfromthehybridizingsignalsonmicroarray,thespecificityandsensitivityintheHEVdiagnosisweresatisfactoryandtheresultswerealsodetectedbyRT-PCR.ConclusionUsingtheprobestoprepareth

6、eDNAmicroarrayforclinicaldiagnosisofHEVisaquickandefectivemethod.Keywords:HEV;microarray;diagnosis戊型肝炎(hepatitisE,HE)是由HE病毒性肝炎,給社會帶來了很大的危害。目前HE的(hepatitisEvirus,HEV)引起的一種經(jīng)糞口途徑傳檢測方法主要有免疫電鏡技術(shù)(IEM)、聚合酶鏈反播的急性傳染病。HE呈全球分布,是世界各地尤應(yīng)(PCR)、酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)和原位雜交。其發(fā)展中國家主要的健康問題之一,成為繼甲型肝但HEV感染窗口期,患者自身免疫系統(tǒng)以及檢測方炎外另一

7、種經(jīng)腸道傳播的嚴(yán)重危害人類健康的病毒法等多方面原因給HE的診斷帶來了難度,因而有必要尋找一種高效、高通量、快速的HEV檢測方收稿日期:2010—06—02法_3j?;蛐酒夹g(shù)按照堿基互補(bǔ)配對原則,探針基金項目:廣東省重點(diǎn)實驗室建設(shè)經(jīng)費(fèi)資助(2004B60144)特異性地結(jié)合相應(yīng)被熒光標(biāo)記的分子,并通過對雜作者簡介:王治偉(1971一),碩士,副主任技師,主要從事免疫學(xué)研究;通訊作者:馬文麗,教授,博士生導(dǎo)師

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