大豆中GmRAD與GmDIV基因的in silico鑒定及表達(dá)分析-論文.pdf

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1、分子植物育種,2012年,第10卷,第2期,第155—162頁(yè)MolecularPlantBreeding,2012,Vo1.10,No.2,155—162研究報(bào)告ResearchReport大豆中GmRAD與GmD基因的scD鑒定及表達(dá)分析魏海超郝榮華李方正楊桂文馮獻(xiàn)忠山東省高校系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,濟(jì)南,250014通訊作者,fengxianzhong@yahoo.corn;yanggw@sdnu.edu.ca摘要RAD與DIV屬于MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員,在金魚(yú)草研究中發(fā)現(xiàn)它們對(duì)花對(duì)稱(chēng)性的形成起著重要作用。本研究利用全基因組信息鑒定了大豆中的Gm

2、RAD與GmDIV基因,分析了其蛋白的理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu),基因結(jié)構(gòu)與其在染色體上的分布,并對(duì)其系統(tǒng)發(fā)生和表達(dá)方式進(jìn)行了研究。研究表明:大豆中存在5個(gè)GmRAD基因和5個(gè)GmDIV基因,它們分別屬于MYB家族的Rl和R2R3類(lèi),分布在大豆的9條染色體上;進(jìn)化分析顯示GmRAD和GmDIV基因具有不同的進(jìn)化歷程,GmDIV比GmRAD基因更趨于單元發(fā)生:表達(dá)分析證明,GmDIV和GmRAD成員具有不同的表達(dá)模式,其中GmRAD3和GmRAD5以及GmDIV1、GmDIV3、GmDIV4和GmD,5在花組織中有較高的表達(dá)。關(guān)鍵詞大豆,GmRAD基因,GmDIV基因,生物信息學(xué)分析,

3、花發(fā)育InsilicoIdentificationandExpressionAnalysisoftheGmRADandGmDlVGenesinSoybeanWeiHaichaoHaoRonghuaLiFangzhengYangGuiwen’FengXianzhongKeyLaboratoryofSystemsBiologyinUniversitiesofShandong,CollegeofLi~Science,ShandongNormalUniversity,Jinan,250014Correspondingauthors.fengxianzhong@yahoo.tom;ya

4、nggw@sdnu.edu.cnDOI:10.3969/mpb.010.000155AbstractTwoMYBtranscriptionfactors,RADIALIS(RAn)andD1VARICATA(DIV),playanimportantroleinthecontrolofflowersymmetryinAntirrhinum.Inthisstudy,GmRADandGmDIVgenesinsoybeanwereidentifiedthroughagenome—widebioinformaticsanalysis.Thebiochemicalpropertiesan

5、dsecondarystructuresoftheirproteins,aswellastheirgenestructuresandtheirdistributionsinchromosomeswereallanalyzed.Theirphylogenyandexpressionpatternwerealsoinvestigated.ThisresearchshowsthatinsoybeantherearefiveGmRADgenesandfiveGmDIVgenes,whichbelongtoR1classandR2R3classofMYBfamilyrespective

6、ly,andtheyaredistributedinninechromosomesofsoybeangenome.PhylogeneticanalysisindicatesGmRADgenesandGmDIVgenesevolvedthroughdiferentpathsduringspeciation,andGmDIVgenesaremorelikelytooriginatedfrommonophylesisthanGmRADgenes.Expressionanalysisshowsthatmembersofthesegeneshavediferentexpressionp

7、atterns,andGmRAD3,GraRAD5,GmDIV1,GmDIV3,GmDIV4arehighlyexpressedinsoybeanflowers.KeywordsSoybean(Glycinemax),GmRADgene,GmDIVgene,Bioinformaticsanalysis,F(xiàn)lowerdevelopment花是被子植物進(jìn)行有性繁殖的主要器官,千姿百經(jīng)過(guò)多次反復(fù)獨(dú)立進(jìn)化而來(lái)(Endress,1999;Stebbins,態(tài)的花型是植物吸引動(dòng)物傳媒和被特異授粉者識(shí)別1974)。研

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