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《H3、H9亞型禽流感病毒雙重?zé)晒舛縋CR方法的建立及初步應(yīng)用-論文.pdf》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、中國動物傳染病學(xué)報(bào)2014,22(1):16—24ChineseJournalofAnimalInfectiousDiseases·研究論文·H3、H9亞型禽流感病毒雙重?zé)晒舛縋CR方法的建立及初步應(yīng)用申偉霞1,2田巧珍,陳圓,胡濤,閆麗萍2李國新,李雪松,滕巧泱,趙宇軍,李澤君(1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院,太谷030801;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海200241)摘要:雖然H3、H9亞型禽流感病毒(Avianinfluenzavirus,AIV)是低致病性禽流感病毒,但其具有跨宿主感染哺乳動物的能力,對社會公共衛(wèi)生安全具有重大的潛在危害
2、,因而對這些亞型病毒的監(jiān)測極其重要。通過比對GenBank上H3、H9亞型禽流感病毒HA基因序列,設(shè)計(jì)了分別針對H3AIV和H9AIV的特異性探針。特異性試驗(yàn)和標(biāo)準(zhǔn)曲線試驗(yàn)的結(jié)果顯示,這兩個探針僅分別特異性識別H3、H9亞型AIV,且具有較好的擴(kuò)增效率。通過重組質(zhì)粒pMD19一T-H3HA和pMD19.T-H9HA10倍梯度稀釋液為模板,進(jìn)行敏感性實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,本研究所建立的熒光定量PCR方法能檢測到100個DNA拷貝數(shù)H3AIV和10個DNA拷貝數(shù)的H9AIV,比傳統(tǒng)PCR方法敏感性分別提高了100倍和1000倍。此外,本方法還能檢測到10EID的H
3、3亞型AIV或H9亞型AIV,比傳統(tǒng)PCR方法檢測敏感性均提高了1000倍。批間和批內(nèi)試驗(yàn)的變異系數(shù)均小于3%,表明本研究建立的方法具有較好的重復(fù)性。此外,與傳統(tǒng)PCR方法相比,用H3、H9亞型AIV雙重?zé)晒舛縋CR方法檢;NA-~感染動物的肺組織時,針對H3AIV的敏感性提高了10~100倍,針對H9AIV的敏感性提高了100倍。綜上所述,本研究所建立的H3、H9亞型禽流感病毒雙重?zé)晒舛縋CR方法具有較高的特異性和敏感性,對H3、H9亞型禽流感病毒監(jiān)測具有重要的應(yīng)用價值。關(guān)鍵詞:H3;H9;禽流感病毒;熒光定量PCR中圖分類號:$852.659.5
4、文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號:1674—6422(2014)01—0016—09DEVELoPMENTANDPRELIMINARYAPPLICATIoNoFFLUoRESCENTQUATI11ATIVEPCRASSAYFoRDETECTIoNoFH3ANDH9SUBTYPESoFAVIANINFLUENZAVIRUSSHENWei.xia’,TIANQiao—zhen,CHENYuan2HUTao,YANLi—ping。,LIGuo—xin,LIXue.song,TENGQiao.yang,ZHAOYu-jun,LIZe-jun2(1.Collegeofani
5、malscienceandtechnology,ShanxiAgriculturalUniversity,Taigu030801.China:2.ShanghaiVeterinaryResearchInstitute,CAAS,Shanghai200241,China)Abstract:AlthoughH3andH9subtypesofAvianinfluenzavirus(AIV)arelowpathogenicinbirds,theyhaveadaptedabilitiestoinfectmammalians,whichposespotentialt
6、hreattohumanbeings.Therefore,surveillanceofH3andH9subtypesofAIVisimportantforpublic收稿日期:2013-l2-18基金項(xiàng)目:國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)(2011AA10A200);國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31302115);中央級公益性科研所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金項(xiàng)目(2013JB06);公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201003012);上海市科委現(xiàn)代農(nóng)業(yè)領(lǐng)域重點(diǎn)科技攻關(guān)項(xiàng)目(12391902000)作者簡介:申偉霞,女,碩士研究生,預(yù)防獸醫(yī)學(xué)專業(yè)通信作者:李澤君,
7、E—mail:lizejun@shvri.a(chǎn)c.cn;趙宇軍,E—mail:tgzhaoyujun@l63.com;滕巧泱,E—mail:tengqy@shvri.a(chǎn)c.cn第22卷第l期申偉霞等:H3、H9亞型禽流感病毒雙重?zé)晒舛縋CR方法的建立及初步應(yīng)用health.Inthepresentstudy,TaqManprimersspecificforeitherH3orH9subtypeweredesignedtodevelopfluorescentquantitativePCR(qPCR)bycomparingthehomologyofHAgen
8、esequencessubmiRedontheGenBank.Thespecif