無(wú)核荔枝myb轉(zhuǎn)錄因子基因克隆和進(jìn)化研究

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1、無(wú)核荔枝MYB轉(zhuǎn)錄因子基因克隆和進(jìn)化研究摘要為獲得在無(wú)核荔枝中胚珠退化過(guò)程中差異表達(dá)全長(zhǎng)MYB轉(zhuǎn)錄因子基因,并為其功能研究打下基礎(chǔ),根據(jù)從已構(gòu)建的無(wú)核荔枝胚珠敗育SSH消減文庫(kù)中得到的差異表達(dá)的MYB轉(zhuǎn)錄因子EST序列,提取髙質(zhì)量的總RNA,運(yùn)用SMARTRACE技術(shù),獲得一個(gè)1177bp的MYE基因核昔酸序列。生物信息學(xué)分析表明,該序列含有879bp的開(kāi)放閱讀框,推測(cè)的蛋白質(zhì)為292個(gè)氨基酸,具有2個(gè)SANT結(jié)構(gòu)功能域,在系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)上與大豆MYB基因親緣關(guān)系最近。該基因?yàn)镸YB基因家族中的新成員。關(guān)鍵詞MYB;無(wú)核荔枝;基因克隆

2、;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)中圖分類(lèi)號(hào)Q78文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào)1007-5739(2013)22-0058-04CloningandPhylogenyAnalysisofMYBTranscriptionFactorfromSeedlessLitchiLIUXing-diLIMing-fangZHENGkaiZHENGXue-qin(InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnology,ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences,HaikouHainan57110

3、1)AbstractToobtainthefulllengthofMYBgeneandlaythefoundationitsfunctionresearchthatwasdifferentiallyexpressedinovuledegenerationofseedlesslitchi.TheESTencodingMYBwasobtainedfromyoungabortiveovuleofseedlesslitchiviaSSH(suppressionsubtractivehybridization),highqualitytot

4、alRNAwasextractedandobtaineda1177bpfulllengthcDNAsequencebySMAT-RACEmethod,bioinformaticsanalysisshowedthatitincludedan879bpopenreadingframe,encodedadeducedproteinwith292aminoacids,andcontained2SANTdomains,phylogenetictreeshoweditgottheclosestrelativeswithGlycinemax.T

5、heresultsshowedthatit,sanewmemberoftheMYBfamily.KeywordsMYB;seedlesslitchi;genecloning;phylogenictreeMYB(myeloblastosis)基因家族是一類(lèi)廣泛存在于植物、動(dòng)物和真菌中的轉(zhuǎn)錄因子家族[1],在植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中起著非常重要的作用[2-3]o近年來(lái),越來(lái)越多的MYB基因被發(fā)現(xiàn),僅在擬南芥和水稻中已分別有339、230個(gè)[4]。MYB基因在植物中有各種不同的功能。主要表現(xiàn)在:一是參與對(duì)植物激素的應(yīng)答。AtMYB2是擬南芥中

6、第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)受ABA誘導(dǎo)的R2R3MYB基因[5],AtMYB2蛋白和RdBPlbHLH蛋白的互作可能是ABA應(yīng)答的另一途徑[6],隨HvGAMYB蛋白的表達(dá)量增加,花藥將會(huì)變小,顏色變淡;當(dāng)其表達(dá)量超過(guò)對(duì)照株4倍時(shí),花藥不能正常開(kāi)裂而導(dǎo)致雄性不育[7],MYB基因還參與生長(zhǎng)素、細(xì)胞分裂素和乙烯的應(yīng)答反應(yīng)[8]。二是參與苯丙素代謝途徑,表現(xiàn)在MYB蛋白對(duì)花色素形成有調(diào)節(jié)作用,在轉(zhuǎn)基因煙草中影響各器官的顏色[9],在萬(wàn)苣中AtMYB60可使紅色素合成受限[10],MdMYBl影響蘋(píng)果的果皮顏色[11]以及玉米褐色組織的合成[12]o

7、三是參與抵抗逆境脅迫的應(yīng)答,如蘋(píng)果MdMYBl0能增強(qiáng)抗?jié)B透能力[13],擬南芥AtMYB102通過(guò)調(diào)節(jié)鑲嵌阻遏蛋白的積累增強(qiáng)耐鹽力[14],甜菜BvMYB對(duì)抵抗鹽脅迫有較好的作用[15],TaMYB33能顯著提高擬南芥的耐旱能力[16]。四是參與植物細(xì)胞的形態(tài)和模式建成,Slabaughetal的研究表明,MaMYE與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜共同作用影響了根的伸長(zhǎng)[15],擬南芥中AtMyb6對(duì)種皮黏液沉積和釋放起重要作用[17],AtMyb26和HvGAMyb參與了花藥形態(tài)建成[18-19],AtMYB115和AtMYB118對(duì)種子胚的發(fā)育有

8、較大影響,AtMYB38、AtMYB30和AtMYB18/LAFl參與了下胚軸的伸長(zhǎng)中的調(diào)控作用[20-22]。海南無(wú)核荔枝是荔枝中的珍稀品種,無(wú)核率高達(dá)95%,可食率可達(dá)90%,是荔枝中可食率最高的品種[23],具有極高的市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)力。無(wú)核荔枝胚珠

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