無核荔枝myb轉(zhuǎn)錄因子基因克隆和進(jìn)化研究

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1、無核荔枝MYB轉(zhuǎn)錄因子基因克隆和進(jìn)化研究摘要為獲得在無核荔枝中胚珠退化過程中差異表達(dá)全長MYB轉(zhuǎn)錄因子基因,并為其功能研究打下基礎(chǔ),根據(jù)從已構(gòu)建的無核荔枝胚珠敗育SSH消減文庫中得到的差異表達(dá)的MYB轉(zhuǎn)錄因子EST序列,提取髙質(zhì)量的總RNA,運(yùn)用SMARTRACE技術(shù),獲得一個1177bp的MYE基因核昔酸序列。生物信息學(xué)分析表明,該序列含有879bp的開放閱讀框,推測的蛋白質(zhì)為292個氨基酸,具有2個SANT結(jié)構(gòu)功能域,在系統(tǒng)發(fā)育樹上與大豆MYB基因親緣關(guān)系最近。該基因?yàn)镸YB基因家族中的新成員。關(guān)鍵詞MYB;無核荔枝;基因克隆

2、;系統(tǒng)進(jìn)化樹中圖分類號Q78文獻(xiàn)標(biāo)識碼A文章編號1007-5739(2013)22-0058-04CloningandPhylogenyAnalysisofMYBTranscriptionFactorfromSeedlessLitchiLIUXing-diLIMing-fangZHENGkaiZHENGXue-qin(InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnology,ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences,HaikouHainan57110

3、1)AbstractToobtainthefulllengthofMYBgeneandlaythefoundationitsfunctionresearchthatwasdifferentiallyexpressedinovuledegenerationofseedlesslitchi.TheESTencodingMYBwasobtainedfromyoungabortiveovuleofseedlesslitchiviaSSH(suppressionsubtractivehybridization),highqualitytot

4、alRNAwasextractedandobtaineda1177bpfulllengthcDNAsequencebySMAT-RACEmethod,bioinformaticsanalysisshowedthatitincludedan879bpopenreadingframe,encodedadeducedproteinwith292aminoacids,andcontained2SANTdomains,phylogenetictreeshoweditgottheclosestrelativeswithGlycinemax.T

5、heresultsshowedthatit,sanewmemberoftheMYBfamily.KeywordsMYB;seedlesslitchi;genecloning;phylogenictreeMYB(myeloblastosis)基因家族是一類廣泛存在于植物、動物和真菌中的轉(zhuǎn)錄因子家族[1],在植物生長發(fā)育過程中起著非常重要的作用[2-3]o近年來,越來越多的MYB基因被發(fā)現(xiàn),僅在擬南芥和水稻中已分別有339、230個[4]。MYB基因在植物中有各種不同的功能。主要表現(xiàn)在:一是參與對植物激素的應(yīng)答。AtMYB2是擬南芥中

6、第一個被發(fā)現(xiàn)受ABA誘導(dǎo)的R2R3MYB基因[5],AtMYB2蛋白和RdBPlbHLH蛋白的互作可能是ABA應(yīng)答的另一途徑[6],隨HvGAMYB蛋白的表達(dá)量增加,花藥將會變小,顏色變淡;當(dāng)其表達(dá)量超過對照株4倍時,花藥不能正常開裂而導(dǎo)致雄性不育[7],MYB基因還參與生長素、細(xì)胞分裂素和乙烯的應(yīng)答反應(yīng)[8]。二是參與苯丙素代謝途徑,表現(xiàn)在MYB蛋白對花色素形成有調(diào)節(jié)作用,在轉(zhuǎn)基因煙草中影響各器官的顏色[9],在萬苣中AtMYB60可使紅色素合成受限[10],MdMYBl影響蘋果的果皮顏色[11]以及玉米褐色組織的合成[12]o

7、三是參與抵抗逆境脅迫的應(yīng)答,如蘋果MdMYBl0能增強(qiáng)抗?jié)B透能力[13],擬南芥AtMYB102通過調(diào)節(jié)鑲嵌阻遏蛋白的積累增強(qiáng)耐鹽力[14],甜菜BvMYB對抵抗鹽脅迫有較好的作用[15],TaMYB33能顯著提高擬南芥的耐旱能力[16]。四是參與植物細(xì)胞的形態(tài)和模式建成,Slabaughetal的研究表明,MaMYE與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜共同作用影響了根的伸長[15],擬南芥中AtMyb6對種皮黏液沉積和釋放起重要作用[17],AtMyb26和HvGAMyb參與了花藥形態(tài)建成[18-19],AtMYB115和AtMYB118對種子胚的發(fā)育有

8、較大影響,AtMYB38、AtMYB30和AtMYB18/LAFl參與了下胚軸的伸長中的調(diào)控作用[20-22]。海南無核荔枝是荔枝中的珍稀品種,無核率高達(dá)95%,可食率可達(dá)90%,是荔枝中可食率最高的品種[23],具有極高的市場競爭力。無核荔枝胚珠

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