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《大豆DGAT基因家族的鑒定和表達分析-論文.pdf》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、中國雇c童報2013,29(12):55—61ChineseAgriculturalScienceBulletin大豆DGAT基因家族的鑒定和表達分析劉貴芹,邵群,黃榮峰,馮獻忠(山東省高校系統(tǒng)生物學重點實驗室/山東師范大學生命科學學院,濟南250014)摘要:旨在利用生物信息學方法鑒定大豆DGAT基因,為其功能研究奠定基礎。通過生物信息學的方法,在全基因組水平上對大豆DGAT基因家族進行了鑒定和分類,并分析了其基因結構、蛋白質結構域特征、系統(tǒng)發(fā)生及基因表達方式。結果表明:大豆中存在10個DGAT家族基因,分別屬于DGAT
2、I、DGA72、DGA乃亞家族,分布在6條染色體上,其中DGATI亞家族基因主要在莖端分生組織和綠色果莢中表達;DGAT3亞家族基因主要在根中表達;而DGAT2亞家族基因表達范圍最廣,主要在根瘤、葉、花和綠色果莢中表達。大豆DGAT家族基因在結構及表達上的差異揭示了其功能的多樣性及大豆脂肪酸代謝的復雜性,將為研究大豆的脂肪酸代謝途徑提供重要的信息。關鍵詞:脂肪酸合成;DGAT基因家族;基因結構;基因表達中圖分類號:$565.1文獻標志碼:A論文編號:2012.4153CharacterizatiOnandExpressio
3、nAnalysisofDGATGeneFamilyinSoybeanLiuGuiqin,ShaoQun,HuangRongfeng,F(xiàn)engXianzhong(KeyLaboratoryofSyste.~BiologyinUniversitiesofShandonglCollegeofLifeScience,ShandongNormalUniversity,Jinan2500141Abstract:TheaimwastoidentifytheDGATgeneinsoybeanwithbioinformaticsmethod
4、s,andprovidethebasisforstudyingitsfunction.Inthisstudy,DGATfamilygenesofsoybeanwerecharacterizedingenomewide.Theirgenestructuresandsecondarystructuresofproteins,aswellasphylogenyandexpressionpatternwerealsoinvestigated.Phylogeneticanalysischaracterized3classesofDG
5、ATgenesinsoybean,whicharebelongedtoDGAT1,DGAT2andDGAT3,andtheydistributein6chromosomesofsoybeangenome.WholegenomeexpressionanalysisrevealedthatDGAT1subfamilygenesmainlyexpressedinSAMandgreenpodwhileDGAT3subfamilygenesmainlyinroot,DGAT2familygenesbroadlyexpressedin
6、nodule,leaf,flowerandgreenpod.ThedifferenceofDGATgenestructuresandexpressionpatternssuggestedthatthefunctiondiversityandcomplexityoffattyacidmetabolism.Theseresultswillprovideimportantinformationforthefattyacidmetabolismpathwayinsoybean.Keywords:fattyacidsynthesis
7、;DGATgenefamily;genestructure;geneexpression0引言飽和、甘油三酯(TAG)的合成、多不飽和脂肪酸的形植物油脂是植物中最重要的有機化合物之一,在成、脂質體形成等過程。合成后的植物油脂主要有兩植物生長、發(fā)育和繁衍過程中扮演著重要的角色。植個去向:一是用來構成生物膜的甘油脂和磷脂;另一個物油脂生物合成包括脂肪酸鏈的合成、終止、釋放、脫是貯藏在種子中即貯藏油脂,常以TAG的形式存在】?;痦椖浚荷綎|省自然科學基金項目“大豆突變體庫的構建及農藝性狀相關突變體的篩選”(ZR2011CM020
8、);濟南市科技發(fā)展計劃課題“具抗氧化功能稻米的開發(fā)和利用研究”(201102031)。第一作者簡介:劉貴芹,女,1987年出生,碩士,研究方向為植物發(fā)育生物學。通信地址:250014山東省濟南市文化東路88號山東師范大學生命科學研究中心,Tel:0531-86180792,E.mail:liuguiqi