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《立枯絲核菌ag1ia誘導(dǎo)玉米差異表達(dá)基因的研究》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、'●j摘要玉米紋枯病是由立枯絲核菌RhizoctoniasolamKOhn引起的真菌性病害。盡管該病主要發(fā)生在中國和東南亞地區(qū),表現(xiàn)出一定的區(qū)域性,但是該病在近年內(nèi)表現(xiàn)出逐年加重和快速蔓延的趨勢,極有可能在未柬幾年傳播到其他國家和地區(qū),并成為一種世界性病害,在我國玉米主產(chǎn)區(qū),該病已成為制約玉米產(chǎn)量高低的主要病害,深入研究玉米對紋枯病的抗病機(jī)制,是尋找培育廣譜、高效、穩(wěn)定、持久抗病性品種的有效途徑。本研究利用電鏡檢測技術(shù)、抑制消減雜交(SSH)cDNA文庫構(gòu)建技術(shù)、反向Northern篩選技術(shù)、RT-
2、PCR以及生物信息學(xué)分析方法相結(jié)合,通過建立相關(guān)抗病基因表達(dá)譜,從全基因表達(dá)的水平上探索玉米對紋枯病的系統(tǒng)抗病機(jī)制。實(shí)驗(yàn)所用材料為本課題組多年篩選鑒定出的高耐玉米紋枯病材料R15,紋枯病菌為立枯絲核菌高致病性融合菌群AGI—IA。玉米種子經(jīng)表面消毒,發(fā)芽,溫室培育幼苗至五葉期后移入大陽,拔節(jié)期時(shí)采用人工嵌入法將兩??繚M菌絲的麥粒接種到植株下位第三葉鞘,接種后接種部位用塑料袋包裹以保溫、保溫,接種6小時(shí)后取下塑料袋,分別取接種后12h、24h、36h、48h、60h、72h、84h、96h的玉米第三下
3、位的葉片和葉鞘,電鏡觀察菌絲在接種葉鞘組織中的形態(tài)變化,提取葉片的總RNA構(gòu)建SSH差減文庫。獲得的主要結(jié)果如下:1.采用電鏡檢測病菌的侵染過程后發(fā)現(xiàn),接種12h后,菌絲在葉鞘細(xì)胞表面伸長并生成少量分支;接菌后24h,菌絲交錯(cuò)生長,呈現(xiàn)多分支的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu);按菌后36h菌絲繼續(xù)分支、交錯(cuò)、纏結(jié),形成侵染摯雛形:接種后48h形成成熟侵染摯;接種后60h,侵染墊繼續(xù)增大,形成團(tuán)狀或帶狀菌絲團(tuán);接種后72h、84h、96h,伴隨新一輪的菌絲生長、分支、侵染摯形成等在葉鞘組織上擴(kuò)展,從而完成對寄主的擴(kuò)大侵染。另
4、外,在接種24h后的各時(shí)IBJ段均觀測到菌絲通過侵染釘直接進(jìn)入寄主或菌絲通過氣孔侵入寄主,病原菌大面積侵入寄主是在接菌后36,.-48h。而在接種72h以后,在葉鞘組織的橫斷面內(nèi)發(fā)現(xiàn)侵入的菌絲,說明菌絲侵入寄主后能在受侵細(xì)胞問擴(kuò)展。2.應(yīng)用數(shù)碼相機(jī)記錄病斑擴(kuò)展過程后發(fā)現(xiàn),接種部位在接種后12h未出現(xiàn)病斑:在接種后24h有水浸狀小病斑出現(xiàn);接種后36h病斑喪失葉綠素而呈白色;接種48h后在形成的白斑周圍出現(xiàn)新的水浸狀病斑的大面積擴(kuò)展;接種后60h擴(kuò)大的病斑喪失葉綠素呈白色,并與之薊白色病斑連在一起組成
5、兩個(gè)明顯的病斑;接種后72h,水浸狀病斑再次出現(xiàn)并逐漸縱下擴(kuò)展,麗之前形成的兩個(gè)病斑輪廓更加明顯:接種后84h形成3個(gè)白色病斑;接種后96h水浸狀病斑繼續(xù)擴(kuò)展,且與前面三個(gè)病斑相連,形成典型的紋枯病發(fā)病癥狀。3.通過SSH和文庫構(gòu)建技術(shù),分別構(gòu)建了R15受紋枯病病菌誘導(dǎo)后的正向和反向文庫。其中正向文庫包含480個(gè)克隆,反向文庫包含288個(gè)克隆。文庫插入片段的長度介于200--,750bp之間,平均長度在450bp左右。4.通過反向Northern雜交篩選,從正向文庫中篩選到正反雜交信號差異顯著的陽性
6、克隆54個(gè),從反向文庫中篩選到陽性克隆30個(gè)。將篩選到的陽性克隆送交測序公司測序,序列經(jīng)DNAMAN軟件去除載體冗余和引物序列后進(jìn)行序列問同源性比對,共獲得51條唯一的EST序列,其中來源于正向文庫的EST序列30條,來源于反向文庫的EST序列2l條。5.將篩選獲得的5l條EST序列提交到Genbank進(jìn)行Blast比對,共獲得已知基因功能的EST序列35條,已知mRNA序列12條,新發(fā)現(xiàn)EST序列4條。對已知基因功能進(jìn)行分類后發(fā)現(xiàn);基因參與抗病或防御途徑(23%)、信號傳導(dǎo)(20%)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控(1
7、7%)、次級代謝(14%)、蛋白質(zhì)修飾加工(6%)、初級代謝(6%)、能量代謝(6%)、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)(6%)等代謝途徑,另外還有1個(gè)與細(xì)胞結(jié)構(gòu)(3%)有關(guān)。6.采用RT-PCR方法對幾個(gè)重要功能的基因進(jìn)行不同時(shí)間段的表達(dá)驗(yàn)證,分析與玉米紋桔病菌誘導(dǎo)抗性相關(guān)基因的時(shí)空表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)不同功能的基因在不同時(shí)間段的誘導(dǎo)表達(dá)量各不相同。7.利用生物信息學(xué)方法并結(jié)合比較基因組學(xué)手段,將本試驗(yàn)獲得的已知功能的35條EST序列,與水稻基因組進(jìn)行比對,確定其在水稻染色體上的位置,并得到與其緊密連鎖的分子標(biāo)記,利用比
8、較圖譜分析該標(biāo)記在玉米染色體上的同源標(biāo)記,獲得了其中25條EST序列在玉米染色體上的SSR標(biāo)記。而令我們感興趣的是一條代表絲氨酸羧肽酶基因的EST序列經(jīng)分析后發(fā)現(xiàn),在水稻基因組中與該EST序列臨近的SSR標(biāo)記為RM25574,而該標(biāo)記與玉米第一染色體上的SSR標(biāo)記umcl245同源,同時(shí)該標(biāo)記又與課題組利用R15作為抗性親本構(gòu)建的群體所定位的玉米紋枯病抗性QTLqBLSBl一c緊密連鎖,另有四個(gè)差異基因與抗性QTL存在連鎖關(guān)系.8.對本試驗(yàn)獲得的功能基因進(jìn)行系統(tǒng)研究后