刺參遺傳多樣性的微衛(wèi)星及RAPD分析

刺參遺傳多樣性的微衛(wèi)星及RAPD分析

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時間:2019-05-11

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1、上海水產大學碩士學位論文仿刺參遺傳多樣性的微衛(wèi)星及RAPD分析摘要本研究以煙臺、蓬萊、威海、大連4個地理種群及養(yǎng)殖和自然群體的仿刺參(又稱刺參)為研究對象,采用RAPD和SSR兩種分子標記對四個群體的遺傳結構進行了研究。分析了刺參養(yǎng)殖群體和自然群體之間的遺傳變異,以及四群體之間的遺傳分化。主要結果如下:1.用經過篩選的9個微衛(wèi)星座位對刺參養(yǎng)殖群體和自然群體進行擴增,每個座位檢測到的等位基因數為4~12個。自然和養(yǎng)殖群體中,有效等位基因平均數分別為6.5556和5.8889,期望雜合度的平均值分別為0.7641和0.6941,觀測雜合度的平均值分別為0.6416和0.5635。根據

2、群體中各座位等位基因頻率計算出兩群體間的遺傳相似度為O.7970、遺傳距離為0.2269。對兩群體進行Hardy—Weinberg平衡檢驗發(fā)現,自然群體在位點腳1828、Psj2022、Psi2642,養(yǎng)殖群體在位點Psi2022,Psj2031,Psj2409,Psj2642,Psi2889都出現了雜合子缺失現象,特別是養(yǎng)殖群體在位點Psj2022,其Hardy-weinberg遺傳偏離指數達0.5164。結果表明,與自然群體相比,刺參養(yǎng)殖群體存在雜合度降低,遺傳多樣性下降的現象,這可能與人工養(yǎng)殖過程中,群體較小,引起近交機會增加有關。應制定相應的漁業(yè)生產和管理措施加以保護,以

3、使刺參養(yǎng)殖持續(xù)健康發(fā)展。2.運用微衛(wèi)星DNA技術對刺參煙臺群體、威海群體、大連群體上海水產大學碩士(博士)學位論文GeneticDiversityandPopulationStructureofApostichopusjaponicusRevealedbyRAPDandSSRMarkersAbstractTwotypesofnuclearmolecularmarkers:randomlyamplifiedpolymorphicDNA(RAPD)andsimplesequencerepeats(SSR)molecularmarkerswereusedtodetectthegenet

4、icdiversityandanalyzethegeneticdivergenceamongfourpopulationsofApostichopusjaponicus,whichwerefromYantai,Penglai,WeilmiandDalian.11他mainresuItswereasfollows:I.9mierosatellitemarkerswereusedtoestimatethelevelofgeneticdiversitybetweenthemturalpopulationandtheculturedpopulationofApostichopusjapo

5、nicus,andcomparedthedegreeofgeneticdifferentiationbetweenthem.ThenumberofallelesgenemtedfTomeachlocusrangedfromfourtotwelveatthenineassessedloci.Themeanvalueofeffectivealleles(ae)inthenaturalpopulationgandculturedpopulationwere6.5556and5.8889;valuesofexpectedheterozygosity(恁)we[eO.7641and0.69

6、41andvaluesoftheaverageobservedheterozygosity(Ho)wereO.6416andO.5635,respectively.TberesultsshowedthatthenaturalresoIⅡ1ccofApostichopusjaponicusinChinawasingoodconditionwimhighergeneticdiversityandtherewasgreatpotentialinpiscatorialgeneticimprovement.Thehetreozygosityandproportionofpolymorphi

7、clociofculturedpopulationwerelowerthanthatofthenatlnmpopulation,whichcouldberelatedtoapossiblepopulationbottleneckassociatedwithbreedingpractice.TheapproachessuchasMarkerAssistedSelection(MAS)shouldbeinducedintotheApostichopusjaponicusculture

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