黃藤遺傳多樣性的rapd分析

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1、林業(yè)科學(xué)研究鶫文章編號(hào)!"#黃藤遺傳多樣性的分析!楊華!尹光天!甘四明!白嘉雨!李榮生!楊錦昌!陳和明中國林業(yè)科學(xué)研究院熱帶林業(yè)研究所廣東廣州浙江省林業(yè)科學(xué)研究院浙江杭州福建農(nóng)林大學(xué)林學(xué)院福建福州摘要!利用標(biāo)記從水平對收集的個(gè)天然黃藤種群進(jìn)行遺傳多樣性分析條引物擴(kuò)增得到條片段整個(gè)種的多態(tài)性位點(diǎn)比率為指數(shù)為信息指數(shù)為黃藤種的遺傳多樣性為種群間的遺傳分化系數(shù)為各種群間的遺傳變異非常小個(gè)種群間的遺傳相似性分析結(jié)果顯示毛感鄉(xiāng)和尖峰嶺種群間的遺傳相似度最高吊羅山和壩王嶺種群間的遺傳相似度最低分析結(jié)果表明種群間基因分化系數(shù)為大部分遺傳變異來源于群體內(nèi)研究結(jié)果揭示收集的天然黃藤種群具有較高的遺傳多樣性

2、有良好的保存和利用價(jià)值尖峰嶺種群可以作為重點(diǎn)保護(hù)關(guān)鍵詞!黃藤遺傳多樣性遺傳分化中圖分類號(hào)!文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼!黃藤具刺攀援藤本是中國特有種天然分布以海南島為屬棕櫚科省藤亞科省藤族中心延伸至以南的廣東和廣西南部地黃藤屬為區(qū)由于黃藤天然分布正在縮小現(xiàn)有天然資源收稿日期基金項(xiàng)目國家十五攻關(guān)課題棕櫚藤種質(zhì)資源培育及利用技術(shù)作者簡介楊華女江蘇揚(yáng)州人博士生森林培育專業(yè)主要研究方向?yàn)闊釒е参镞z傳育種林業(yè)科學(xué)研究第卷多集中于海南島中部及西南部山區(qū)在廣東和廣西為采集地采集點(diǎn)的基本情況見表對生長良好已基本找不到天然生長的黃藤僅在一些次生林及的藤叢采集同母半同胞家系的果實(shí)分株標(biāo)記每兩人工林中仍有生長個(gè)個(gè)體的間距在以上

3、果實(shí)采后立即去皮國內(nèi)外對棕櫚藤天然資源的研究多集中在收集沙藏育苗年月初種子陸續(xù)出苗后移苗于及保存上對其遺傳多樣性研究鳳毛麟角特別是黃營養(yǎng)袋中年月每個(gè)家系隨機(jī)選擇一個(gè)子藤尚未有報(bào)道遺傳多樣性的研究可以分析種質(zhì)代采當(dāng)年生嫩葉用于遺傳多樣性分析因不同地資源的多樣性狀況為種質(zhì)資源的開發(fā)利用提供依點(diǎn)種群個(gè)體數(shù)量及年結(jié)果量不同部分地區(qū)采集的據(jù)為育種材料的選擇提供信息有些物種雖然已樣本數(shù)比較少采取措施進(jìn)行保存但所保存的遺傳多樣性并不能基因組的提取和反應(yīng)體系及擴(kuò)代表該物種的遺傳多樣性如夏蠟梅增程序見參考文獻(xiàn)選擇擴(kuò)增條帶較多且清楚的引物條電泳圖譜中每一擴(kuò)增條帶代表的遷地保護(hù)就未能有效保護(hù)其遺傳多引物的一個(gè)

4、結(jié)合位點(diǎn)視為有效的分子標(biāo)記對樣性因此對種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性的研究照標(biāo)準(zhǔn)分子量標(biāo)記根據(jù)各也是檢驗(yàn)已采取的措施是否有效的一種途徑應(yīng)用分子標(biāo)記的遷移率將電泳圖譜中較為清晰的條表型分析同工酶及分子標(biāo)記技術(shù)分析棕櫚藤遺帶包括弱帶計(jì)作無則計(jì)為轉(zhuǎn)換成傳多樣性是實(shí)施育種計(jì)劃的重要背景知識(shí)是育二元矩陣在已有的研究中擴(kuò)增產(chǎn)種研究的趨勢標(biāo)記方法簡便易行高效而物的長度一般在鶫之間此范圍內(nèi)廣泛在遺傳多樣性的分析中已得到廣泛應(yīng)用的擴(kuò)增片段被認(rèn)為是有效穩(wěn)定可重復(fù)的運(yùn)本研究也采用該種方法從整個(gè)基因組的角度對黃用軟件計(jì)算多態(tài)性位點(diǎn)比率指藤天然種群的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性進(jìn)行分析為數(shù)信息指數(shù)遺傳距離和遺傳相似系保護(hù)天然黃藤

5、制定合理措施及基本育種群體的建立數(shù)并運(yùn)用軟件進(jìn)行類平均法提供基礎(chǔ)資料聚類分析同時(shí)應(yīng)用對幾個(gè)種群進(jìn)行種群內(nèi)和種群間的分子變異分析材料與方法年月下旬以黃藤的主要天然分布區(qū)表各種群的基本情況種群采樣地點(diǎn)林分起源藤林起源樣本數(shù)經(jīng)度緯度海拔尖峰嶺海南樂東縣尖峰嶺天然林天然鶫鶫鶫毛感鄉(xiāng)海南保亭縣毛感鄉(xiāng)南昌村天然林天然鶫鶫鶫吊羅山海南陵水縣吊羅山國家森林公園天然林天然鶫鶫鶫壩王嶺海南昌江縣壩王嶺保護(hù)區(qū)天然林天然鶫鶫鶫鶫之間變化表多態(tài)性最高的種群結(jié)果與分析在尖峰嶺多態(tài)性最低的種群在壩王嶺個(gè)種擴(kuò)增片段的多態(tài)性群的多態(tài)性位點(diǎn)比率平均為整個(gè)種條引物對個(gè)黃藤種群的個(gè)個(gè)體進(jìn)的多態(tài)性位點(diǎn)比率為高于任一個(gè)種行擴(kuò)增得到

6、條片段每個(gè)引物擴(kuò)增的條帶群多態(tài)性位點(diǎn)比率的估算與種群內(nèi)個(gè)體數(shù)有數(shù)從條到條平均每條引物可擴(kuò)增得到一定的關(guān)系由于吊羅山和壩王嶺種群采樣個(gè)條片段不同種群同一引物的多態(tài)性位點(diǎn)體數(shù)較少多態(tài)性位點(diǎn)比率也不高而尖峰嶺種和多態(tài)性位點(diǎn)比率是不一樣的表多態(tài)性群樣本數(shù)最多為個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)比率也最位點(diǎn)比率的變化范圍為鶫不高為這也反映了在尖峰嶺有相對更同種群所有引物的多態(tài)性位點(diǎn)比率在廣泛的遺傳基礎(chǔ)第期楊華等黃藤遺傳多樣性的分析表黃藤各種群不同引物的多態(tài)性位點(diǎn)和多態(tài)性位點(diǎn)比率不同地種群引物尖峰嶺毛感鄉(xiāng)吊羅山壩王嶺總擴(kuò)增帶數(shù)多態(tài)性多態(tài)性位點(diǎn)多態(tài)性多態(tài)性位點(diǎn)多態(tài)性多態(tài)性位點(diǎn)多態(tài)性多態(tài)性位點(diǎn)位點(diǎn)比率位點(diǎn)比率位點(diǎn)比率位點(diǎn)比率

7、表黃藤不同種群所有引物的多態(tài)性應(yīng)用軟件分析原始二元矩陣計(jì)算位點(diǎn)比率及遺傳多樣性得到黃藤種的遺傳多樣性為種群內(nèi)遺傳多多態(tài)性位點(diǎn)遺傳多樣性樣性為種群間遺傳多樣性種群單態(tài)性多態(tài)性多態(tài)性位點(diǎn)指數(shù)為種群間的遺傳分化系數(shù)為位點(diǎn)數(shù)位點(diǎn)數(shù)比率信息指數(shù)尖峰嶺由遺傳分化系數(shù)可知種群間的遺傳變異比較毛感鄉(xiāng)小只占總變異的種群間的遺傳相似度吊羅山壩王嶺和遺傳距離見表由表可見毛感鄉(xiāng)和尖峰嶺種平均群間的遺傳相似度最高遺傳距離為吊羅物種山和壩王嶺種群間的遺傳相似度