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《歐洲黑楊基因資源材性關聯(lián)基因的snp分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內(nèi)容在教育資源-天天文庫。
1、HEREDITAS(Beijing)2008年6月,30(6):795―800ISSN0253-9772www.chinagene.cn研究報告DOI:10.3724/SP.J.1005.2008.00795歐洲黑楊基因資源材性關聯(lián)基因的SNP分析122丁明明,黃秦軍,蘇曉華1.國家林業(yè)局國有林場和林木種苗工作總站,北京100714;2.中國林業(yè)科學研究院林業(yè)研究所國家林業(yè)局林木培育重點實驗室,北京100091摘要:以115個歐洲黑楊(PopulusnigraL.)無性系為材料,利用TaqMan技術分析了歐洲黑楊基因資源參與木質素和纖維素合成的酶(4CL、P
2、AL和CesA2)的單核苷酸多態(tài)性,并對分型的SNPs與木材材性性狀(物理性狀：基本密度、纖維長、纖維寬、微纖絲角;化學性狀:木質素含量、纖維素含量、α纖維素含量等)進行了相關分析。結果如下:(1)在對4CL、PAL和CesA2等3個基因進行檢測時,共獲得27個SNPs標記,對其中轉換(A-G,C-T)有17個位點,顛換(A-C,G-C,G-T,A-T等)有10個位點;(2)對其中的3個SNPs進行了分型,分別記作SNP1、SNP2和SNP3;(2)對已經(jīng)分型SNPs位點與材性性狀進行方差分析,結果顯示,3個SNPs中只有SNP1與4年生歐洲黑楊綜纖維素含量
3、顯著相關,表現(xiàn)為負效應,貢獻率為11.11%;(3)對歐洲黑楊4CL基因的SNP1標記的不同基因型所對應的材性性狀進行方差分析,結果顯示基因型為CC和CT的歐洲黑楊相對于基因型為TT的歐洲黑楊有較高的纖維素含量。關鍵詞:歐洲黑楊;材性;單核苷酸多態(tài)性AnalysisonSNPslinkedwithwoodpropertiesofPopulusnigraL.generesources122DINGMing-Ming,HUANGQin-Jun,SUXiao-Hua1.GeneralAdministrationofStateForestFarms,Treeseed
4、sandseedlings,SFA,Beijing100714,China;2.TheResearchInstituteofForestry,CAFLaboratoryofTreeBreedingandCultivation,SFA,Beijing100091,ChinaAbstract:Inthisstudy,115PopulusnigraL.collectedfromEuropewereusedasmaterials.TheyweredetectedforSNPsofgeneslinkedwithligninandholocellulose(4CL,PA
5、LandCesA2)byTaqMantechnologyandcorrelationsbetweenSNPsandwoodproperties(thewoodspecielygravity,fiberlength,fiberwidth,microfibreangle,lignin,holocellulosecontentandα-Cellulosecontent)werealsostudied.resultsshowedthat(1)27SNPswereobtainedinthegenes,suchas4CL,PALandCesA2associatedwit
6、hligninsynthesis.Amongthem,17SNPsweretransition(A-G,C-T),10SNPsweretransversion(A-C,G-C,G-T,andA-T).(2)ThreeoftheSNPswerediscriminated,asignificantnegativecorrelationbetweenholocellulosecontentoffour-yearoldP.nigraandSNP1wasdetected,andcontributionratiowas11.11%.SNP2andSNP3hadnosig
7、-nificantcorrelationwithwoodproperties.(3)WoodpropertiesofvariousgenotypesofSNP1weresignificantlydifferent.CCandCTgenotyperelativetoTTgenotypehadlargerholocellulosecontent.SNP1wouldbeanefficientmarkertochoose收稿日期:2007?11?23;修回日期:2008?01?23基金項目:國家“十一五”科技支撐計劃課題(編號:2006BAD01A15)和國家高技術
8、研究發(fā)展“863”計劃課題(編號:2006AA100
