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《東北肉羊lpl基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、分類(lèi)號(hào)UDC密級(jí)編號(hào)專(zhuān)業(yè)碩士學(xué)位論文東北肉羊LPL基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析AssociationAnalysisofLPLGenePolymorphismandMeatQualityTraitsofNortheastMuttonSheep學(xué)位申請(qǐng)人：申正指導(dǎo)教師：趙淑娟教授合作教師：金海國(guó)研究員專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域：養(yǎng)殖學(xué)位類(lèi)別：農(nóng)業(yè)推廣碩士2015年06月獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明，所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下完成的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，文中除了特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研究成
2、果，也不包含為獲得河南科技大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的其他學(xué)位或證書(shū)而使用過(guò)的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示了謝意。研究生簽名：日期：摘要摘要本試驗(yàn)以脂蛋白脂肪酶(LipoproteinLipase,LPL)作為東北肉羊肉質(zhì)性狀的候選基因，研究其外顯子上的單核甘酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)位點(diǎn)及其與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)，為改善肉羊肉質(zhì)及其遺傳育種提供分子生物學(xué)基礎(chǔ)。本試驗(yàn)以48頭成年健康的東北肉羊肌肉組織樣本為材料，提取總RNA與
3、基因組DNA，采用RT-PCR和TA克隆方法成功克隆了東北肉羊的LPL基因cDNA序列并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析；將LPL基因作為肉質(zhì)性狀的候選基因，應(yīng)用直接測(cè)序和PCR-RFLP相結(jié)合的方法對(duì)LPL基因部分外顯子進(jìn)行SNPs篩選，并通過(guò)一般線性模型分析研究了LPL基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)。主要試驗(yàn)結(jié)果如下：1.提取了總RNA，通過(guò)RT-PCR的方法，克隆了東北肉羊LPL基因的完整編碼序列，并對(duì)其進(jìn)行了序列測(cè)定。對(duì)東北肉羊LPL基因完整編碼序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析，結(jié)果表明，東北肉羊LPL基因ORF（開(kāi)放閱讀框）長(zhǎng)1
4、437bp，共編碼了478個(gè)氨基酸。2.通過(guò)直接測(cè)序及PCR-RFLP技術(shù)，對(duì)東北肉羊LPL基因第3、4、5和6外顯子進(jìn)行序列測(cè)定與多態(tài)性分析，發(fā)現(xiàn)LPL基因第3和4外顯子上存在SNPs位點(diǎn)，而第5和6外顯子則未發(fā)現(xiàn)SNPs位點(diǎn)。這些SNPs位點(diǎn)分別是：第3外顯子46bp處T/C(T304C)，第3外顯子126bp處A/T(A384T)，第4外顯子24bp處T/C(T462C)。這3個(gè)SNP位點(diǎn)都沒(méi)有引起氨基酸變異，屬于同義突變。3.對(duì)東北肉羊第3外顯子A384T突變位點(diǎn)進(jìn)行酶切與基因分型，并統(tǒng)計(jì)基因頻率、基因型頻
5、率、χ2-Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)、基因純合度(Ho)、基因雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)、多態(tài)信息含量(PIC)等數(shù)據(jù)。結(jié)果表明，東北肉羊群體在該位點(diǎn)的遺傳變異為低度多態(tài)(PIC＜0.25)，并處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。4.對(duì)第3外顯子A384T突變位點(diǎn)各基因型與肉質(zhì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析，結(jié)果表明該位點(diǎn)TT型滴水損失極顯著高于TA型和AA型(P＜0.01)；TT型pH1值顯著高于TA型(P＜0.05)，與AA型則差異不顯著(P＞0.05)；壓榨損失、熟肉率和剪切力
6、性狀在各基因型間差異不顯著(P＞0.05)。TT型肉豆蔻酸含量顯著低于TA型和AA型(P＜0.05)；TT型棕櫚酸含量顯著低于TA型(P＜0.05)，與AA型則差異不顯著(P＞0.05)；其余脂肪酸含量在各基因型間差異不顯著(P＞0.05)。TT型甘氨酸含量顯著高于TA型(P＜0.05)，與AA型差異不顯著(P＞I摘要0.05)；TT型精氨酸含量顯著高于TA型和AA型(P＜0.05)；其余氨基酸含量在各基因型間差異不顯著(P＞0.05)。關(guān)鍵詞：肉羊；脂蛋白脂酶基因；序列分析；SNPs；肉質(zhì)性狀論文類(lèi)型：研究類(lèi)選題
7、來(lái)源：國(guó)家肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-39)IIABSTRACTABSTRACTIntheexperiment,LPLgeneisconsideredtobecandidategeneaffectingmeatqualitytraitsofnortheastmuttonsheep.MainlystudytheSNPsofexonandtheassociationbetweenSNPsandmeatqualitytraits.Theexperimentresultswouldprovidethemolecularbi
8、ologicalbasistomeatimprovementandgeneticbreedingofmuttonsheep.Muscletissuesfrom48healthyoldernortheastmuttonsheepwerecollectedtoextracttotalRNAandgenomicDNA.ThesequenceofLPLgenecDN
