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《青島百合復(fù)合種群遺傳多樣性的rapd分析》由會(huì)員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、青島百合復(fù)合種群遺傳多樣性的RAPD分析 :對(duì)青島百合(LiliumtsingtauenseGilg)復(fù)合種群6個(gè)局部種群的遺傳多樣性進(jìn)行了RAPD分析。通過11個(gè)引物擴(kuò)增到117個(gè)顯性位點(diǎn),其中多態(tài)性位點(diǎn)平均為62.86%,各百合群體多態(tài)性位點(diǎn)多少順序?yàn)閅5、Y1、Y4、Y6、Y2、Y3。把RAPD多樣性指標(biāo)與樣地的基本狀況進(jìn)行相關(guān)分析,發(fā)現(xiàn)海拔高度、樣地坡度和植被類型與各個(gè)多樣性指標(biāo)呈正相關(guān),樣地坡向與各個(gè)多樣性指標(biāo)呈負(fù)相關(guān)。Neis基因多樣度指數(shù)(h)和Shannon信息指數(shù)(I)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,種群內(nèi)h和I的平均值分別為0.2034和0.3090,這兩個(gè)指數(shù)均為Y5最高,其次為Y1,
2、Y3最低。不同位點(diǎn)在種群間的分化程度差別很大,基因分化度的波動(dòng)范圍為0.0165~0.9427,平均為0.3783。種群間平均基因流為0.8216,說明有遺傳漂變的存在。6個(gè)百合種群間遺傳一致度與遺傳距離的無偏估計(jì)表明,最小的遺傳距離在Y4和Y6之間,最大的遺傳距離在Y3和Y5之間,遺傳一致度則相反。種群聚類分析表明,Y1和Y2比較近;Y4和Y6比較近又和Y5聯(lián)系在一起。Y3比較特殊,單獨(dú)為一類?! £P(guān)鍵詞:青島百合(LiliumtsingtauenseGilg);復(fù)合種群;遺傳多樣性;RAPD;遺傳漂變;遺傳距離 ?。篠682.2;:A:0439-8114(2014)13-3074-04
3、RAPDAnalysisofGeicDiversityoftheLiliumtsingtauenseMetapopulation ZHANGCong-min1,ZHANGZhi-guo2 ?。?.SchoolofBiologicalScienceandBiotechnology,MinnanNormalUniversity,Zhangzhou363000,F(xiàn)ujian,China; 2.SchoolofLifeSciences,ShandongUniversity,Jinan250100,China) Abstract:GeicdiversityofsixLiliumtsingtauen
4、semetapopulationsethodofRAPD.ThegeicdifferentiationamongpopulationsplifiedbyRAPD.Themeansofgeicdiversityationshoeanongpopulations0.0165to0.9427,eanof0.3783.Thechangeofgenefloeansofgenefloongpopulations.FromNeisunbiasedmeasuresofgeicidentityandgeicdistancebyRAPD,it. Keytsingtauense;metapupulations;g
5、eicdiversity;RAPD;geicdrift;geicdistance 青島百合(LiliumtsingtauenseGilg)是我國百合科的特有種,已列入第二批國家保護(hù)植物名錄[1]。由于棲息地干擾的加劇,青島百合的分布范圍日趨縮小,目前,青島百合的集中分布地位于嶗山北九水以南海拔400~1000m的森林群落內(nèi),這一區(qū)域可見到成片分布的種群,均呈斑塊狀分布,斑塊之間的距離依地形、地貌及人類活動(dòng)的強(qiáng)度不同而遠(yuǎn)近不一,以復(fù)合種群存在[2]?! ∧壳皩?duì)百合的研究在國內(nèi)已有不少報(bào)道,主要集中在其地理分布、化學(xué)成分、組織培養(yǎng)、細(xì)胞學(xué)觀察及雜交育種等方面,但鮮見關(guān)于青島百合的研究。一個(gè)物種的
6、穩(wěn)定存在與其群體的遺傳多樣性水平和遺傳結(jié)構(gòu)密切相關(guān)[3],因此對(duì)青島百合遺傳結(jié)構(gòu)的研究將有助于探討其瀕危原因及過程,采取科學(xué)有效的措施進(jìn)行保護(hù),并且能為其分類、進(jìn)化研究提供資料,進(jìn)而為育種和遺傳改良提供遺傳學(xué)依據(jù)。RAPD技術(shù)是一種簡便、快速、易行的分子標(biāo)記技術(shù),試驗(yàn)用RAPD技術(shù)分析了青島嶗山6個(gè)樣地(Y1~Y6)的青島百合復(fù)合種群的遺傳多樣性、群體內(nèi)和群體間的遺傳變異,旨在為青島百合遺傳結(jié)構(gòu)的研究提供依據(jù)?! ?材料與方法 1.1材料 試驗(yàn)從6個(gè)樣地(Y1~Y6)各隨機(jī)取20株青島百合的幼嫩頂芽,迅速置于冰盒中帶回實(shí)驗(yàn)室于4℃保存,7d內(nèi)進(jìn)行總DNA的提取。 1.2方法 1.2.1
7、基因組DNA的提取6個(gè)樣地共120份樣品,采用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法[4]稍作修改后提取基因組DNA,通過瓊脂糖凝膠電泳,LALBgCl2等。反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃變性1min,35℃復(fù)性1min,72℃延伸2min,40個(gè)循環(huán);最后72℃延伸7min。擴(kuò)增反應(yīng)在德國BIOMETRA-GRANDIENTPCR儀上進(jìn)行?! ?.3RAPD數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì) 1.3.1多態(tài)性位點(diǎn)比例(P)P=多態(tài)性