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1、基因工程常用載體END!THANDSFORYOURCOMING!在大腸桿菌的各種菌株中找到了許多種不同類型的質(zhì)粒,其中已經(jīng)作了比較洋盡研究的主要有F成粒、R質(zhì)粒和C。l質(zhì)位.由于這些成粒的存在,寄主細(xì)胞便獲得了各自不同的性狀特征,根據(jù)這些特征來鑒別這三種不同類型的質(zhì)粒;①F質(zhì)粒又叫F因子或性質(zhì)粒(Sexplasmid)。它們能夠使寄主染色淬上的基因和F質(zhì)粒一道轉(zhuǎn)移到原先不存在該質(zhì)粒的受體細(xì)胞中去。②R質(zhì)粒通稱抗藥性因子。它們編碼有一種或數(shù)種抗菌素抗性基因,并且通常能夠?qū)⒋朔N抗性轉(zhuǎn)移到缺乏該質(zhì)粒的適宜的受體細(xì)胞,使后者也獲得同樣的抗菌索抗
2、性能力。③Col質(zhì)粒即所謂產(chǎn)生大腸桿菌素因子。它們編碼有控制大腸桿菌素合成的基因。大腸桿菌素是一類可以使不帶有Col質(zhì)粒的親緣關(guān)系密切的細(xì)菌菌株致死的蛋白質(zhì)。大腸桿菌菌株中不同類型的質(zhì)粒噬菌體λ載體的構(gòu)建野生型噬菌體λDNA全長(zhǎng)約50kb,上有65種限制酶酶切點(diǎn),除ApaⅠ、NaeⅠ、NarⅠ、NheⅠ、SnaBⅠ、XbaⅠ和XhoⅠ等7種限制酶各有一個(gè)切點(diǎn)外,其余都多于2個(gè)。有些酶切點(diǎn)在λ增殖所必需的基因區(qū)域內(nèi)。因此,噬菌體λ必須經(jīng)過改造才能用作載體。現(xiàn)在用的λ載體大都除去了某種限制酶的酶切點(diǎn)。因此,作為載體的噬菌體λ都短于野生型。噬
3、菌體λ載體有兩種類型①插入型。由于改建后的噬菌體λDNA都短于野生型,所以可插入外源DNA。只要插入的位置不影響噬菌體增殖。而且噬菌體DNA缺失越長(zhǎng),插入片段就可越大。②置換型。噬菌體λ的基因組可分為三個(gè)區(qū)域,左側(cè)區(qū)包括使噬菌體DNA成為一個(gè)成熟的、有外殼的病毒顆粒所需的全部基因,全長(zhǎng)約20kb。右側(cè)區(qū)內(nèi)包含所有的調(diào)控因子、與DNA復(fù)制及裂解宿主菌有關(guān)的基因,這個(gè)區(qū)域約長(zhǎng)12kb。中間區(qū)域約長(zhǎng)18kb,這一段DNA可以被外源置換而不會(huì)影響噬菌體λ裂解生長(zhǎng)的能力。置換型噬菌體λ是使用最廣泛的載體。噬菌體λ裂解生長(zhǎng)的能力同包裝在頭蛋白中的λ
4、DNA的大小有關(guān)。當(dāng)DNA的長(zhǎng)度短于野生型的78%或超過105%時(shí),噬菌體的活性就急劇下降。因此要求λ載體DNA和外源DNA長(zhǎng)度之和在39~53kb之間。置換型載體DNA用選定的限制酶完全酶切后,要設(shè)法除去中間片段,只留下左臂和右臂以便用外源DNA片段連接,包裝成重組噬噬體。這是因?yàn)樽蟊酆陀冶叟c中間片段間都有單鏈“粘性末端”,在連接酶作用下可以重新恢復(fù)原來的結(jié)構(gòu),從而影響了同外源DNA的連接。區(qū)分重組噬菌體形成的噬菌斑和重新恢復(fù)的載體噬菌體形成的噬菌斑的方法是用Xgal藍(lán)色噬菌斑試驗(yàn)。有些噬菌體載體的中間片段帶有編碼β半乳糖苷酸的基因。
5、當(dāng)這種噬菌體感染lac宿主細(xì)胞并在含有Xgal(5溴4氯3吲哚βD半乳糖苷)的培養(yǎng)基上生長(zhǎng)時(shí),半乳糖苷酸與Xgal反應(yīng)的產(chǎn)物為不溶性的靛藍(lán)染料。因此,含有中間片段的重新恢復(fù)的噬菌體形成藍(lán)色噬菌斑;而同外源DNA連接的重組噬菌體形成的噬菌斑是無色透明的。單鏈?zhǔn)删w載體(M13)最常用的單鏈?zhǔn)删w載體是M13和它的改建噬菌體。M13是絲狀噬菌體,有長(zhǎng)約6500個(gè)核苷酸的閉環(huán)DNA基因組。M13附著在大腸桿菌的F性菌毛上,所以它們只能感染雄性細(xì)菌,即F’或Hfr細(xì)菌。當(dāng)噬菌體進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞后,單鏈的噬菌體DNA轉(zhuǎn)變成雙鏈復(fù)制型(RF)。從細(xì)胞中
6、分離的RF可用作克隆雙鏈DNA的載體。當(dāng)每個(gè)細(xì)菌細(xì)胞里積聚了200到300份RF型拷貝時(shí),M13開始不對(duì)稱的合成,即只大量合成DNA雙鏈中的一條鏈。單鏈DNA摻入成熟的噬菌體顆粒,顆粒不斷地從感染細(xì)胞上芽生。M13感染雖不殺死細(xì)胞,但細(xì)胞的生長(zhǎng)受到一定的抑制,所以形成混濁的噬菌斑。M13的基因組中除有一段507個(gè)核苷酸,其余都含有與其復(fù)制有關(guān)的遺傳信息。因此,只有在這一段中可插入外源DNA而不致影響噬菌體的活性。用M13作為分子克隆載體的優(yōu)點(diǎn)是從細(xì)菌中釋放出來的噬菌體顆粒只含單鏈DNA,其中包含了克隆DNA片段的二條互補(bǔ)鏈中的一條,因此
7、可用來作為對(duì)DNA測(cè)序的模板。另外,可用來產(chǎn)生單鏈的DNA探針以選擇和分離互補(bǔ)的RNA。M13的RF型是雙鏈DNA,便于限制酶的識(shí)別和切割,克隆進(jìn)雙鏈的外源DNA。從細(xì)菌培養(yǎng)液中大量抽取單鏈DNA。問題是插入M13的外源DNA超1000bp時(shí)就不穩(wěn)定,在噬菌體增殖時(shí)會(huì)出現(xiàn)缺失。一般說,插入300~400bp是相當(dāng)穩(wěn)定的。