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《DB32∕T 3683-2019 豬鏈球菌9型PCR檢測技術(shù)規(guī)程.pdf》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、ICS11.220B41DB32江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)DB32/T3683—2019豬鏈球菌9型PCR檢測技術(shù)規(guī)程TechnicalregulationforPCRdetectingStreptococcussuisSerotype92019-12-03發(fā)布2019-12-25實施江蘇省市場監(jiān)督管理局發(fā)布DB32/T3683—2019前言本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1—2009給出的規(guī)則起草。本標(biāo)準(zhǔn)由江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院提出并歸口。本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院。本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:倪艷秀、何孔旺、周俊明、祝昊丹、呂立新、
2、俞正玉、王丹丹、張雪寒、溫立斌、李彬。IDB32/T3683—2019豬鏈球菌9型PCR檢測技術(shù)規(guī)程1范圍本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了豬鏈球菌9型PCR檢測技術(shù)所用的儀器設(shè)備和主要試劑、引物、方法步驟、結(jié)果判定、廢棄物處理和防止污染的措施等要求。本標(biāo)準(zhǔn)適用于豬鏈球菌9型的PCR檢測。2規(guī)范性引用文件下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6682分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法NY/T541獸醫(yī)診斷樣品
3、采集、保存與運輸技術(shù)規(guī)范《病死及病害動物無害化處理技術(shù)規(guī)范》(農(nóng)醫(yī)發(fā)〔2017〕25號)3術(shù)語和定義下列術(shù)語和定義適用于本文件。3.1豬鏈球菌9型Streptococcussuisserotype9屬于鏈球菌屬的一種細(xì)菌,根據(jù)其莢膜多糖抗原的差異,可分為1-31、33及1/2共33個血清型。豬鏈球菌9型是豬鏈球菌的一個血清型,不僅對豬致病性很強(qiáng),而且可以感染特定的人群,是一種人獸共患病病原菌。4儀器設(shè)備和主要試劑4.1儀器設(shè)備高速離心機(jī)、水浴鍋、PCR儀、核酸電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)。4.2主要試劑生理鹽水、
4、超純水、蛋白酶K、2×PCRMix、瓊脂糖(電泳級)、DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(DL2000Marker)。5引物5.1上游引物:5′-GGCTACATATAATGGAAGCCC-3′。5.2下游引物:5′-CCGAAGTATCTGGGCTACTG-3′。6方法步驟6.1樣品處理6.1.1病料樣品處理1DB32/T3683—2019采用差速離心法,取約5g病料(肝或肺或腦組織),剪碎研磨,用5mL生理鹽水混懸,先2000r/min離心2min,去除大組織塊,取上清液,后10000r/min離心5min,棄上清液,
5、沉淀以200μL超純水重懸,備用。6.1.2待檢培養(yǎng)物樣品處理取待檢液體培養(yǎng)物(純培養(yǎng)物或混合培養(yǎng)物)1mL10000r/min離心5min,棄上清,沉淀以200μL超純水重懸,備用。陰性對照:THB培養(yǎng)基。陽性對照:豬鏈球菌9型標(biāo)準(zhǔn)菌株(22083)的THB培養(yǎng)物。陰性、陽性對照也同樣處理,對每個樣品進(jìn)行編號標(biāo)記。6.2DNA提取取6.1獲得的樣品及對照,每200μL加入3μL蛋白酶K(20mg/mL),42℃作用1h,煮沸5min,10000r/min離心5min,上清作為模板DNA。6.3PCR擴(kuò)增
6、6.3.1反應(yīng)條件按25μL體系進(jìn)行,2×PCRMix12.5μL,上游引物(10pmol/μL)1.0μL,下游引物(10pmol/μL)1.0μL,模板DNA2.0μL,超純水8.5μL。按如下條件進(jìn)行PCR反應(yīng)。95℃5min,然后進(jìn)入循環(huán)94℃30sec,55℃30sec,72℃30sec,35個循環(huán),于72℃延伸10min,4℃保存。6.3.2電泳將PCR反應(yīng)產(chǎn)物于1.2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,電壓為120V,時間30min。6.3.3結(jié)果觀察用凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果,并進(jìn)行拍照。7結(jié)果判定7.1檢
7、測結(jié)果成立條件陽性對照的PCR產(chǎn)物電泳后在389bp的位置上出現(xiàn)一條特異性條帶,陰性對照PCR產(chǎn)物電泳后沒有條帶(見附錄A),檢測結(jié)果成立;否則,結(jié)果不成立。7.2結(jié)果判定7.2.1在檢測結(jié)果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產(chǎn)物電泳后在389bp的位置上出現(xiàn)一條特異性條帶,判為陽性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陽性。7.2.2在檢測結(jié)果成立的前提下,如果檢測樣品中PCR產(chǎn)物電泳后在389bp的位置上未出現(xiàn)一條特異性條帶,判為陰性,即該樣品為豬鏈球菌9型核酸陰性。7.2.3如果陽性對照無相應(yīng)的目的條帶,可能
8、是存在操作失誤,該檢測需要重復(fù)進(jìn)行;如果陰性對照有相應(yīng)的目的條帶,可能是陰性對照存在污染或是操作失誤,該檢測需要重復(fù)進(jìn)行。8廢棄物處理和防止污染的措施檢測過程中的廢棄物,應(yīng)做好無害化處理。檢測過程中防止交叉污染的措施見附錄B。2DB32/T3683—2019附錄A(資料性附錄)豬鏈球菌9型PCR產(chǎn)物電泳圖M122000bp——1000bp——750bp——500bp————389bp250bp——100bp——M——DNA分子