象草遺傳多樣性的rapd分析

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1、廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文象草遺傳多樣性的RAPD分析姓名:藍(lán)亦鋒申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):動物營養(yǎng)與飼料科學(xué)指導(dǎo)教師:賴志強(qiáng)20120628象草遺傳多樣性的RAPI)分析摘要以廣西南寧地區(qū)的9種象草的幼嫩葉片為材料,研究了RAPD—PCR反應(yīng)條件;并應(yīng)用RAPD分子標(biāo)記對9份象草的遺傳多態(tài)性、親緣關(guān)系等進(jìn)行分析,結(jié)果表明:1.RAPD—PCR優(yōu)化的最終體系為:總體積為20此,反應(yīng)體系中含有總體積20皿,反應(yīng)體系中試劑添加量:10xPCRBuffer2.01xl_,、帥s(各10mM)0.4此、primer(10pM)1.2止、M92十(2

2、5mM)1.5止、TaqE(SWIJLL)0.4皿、DNA(10ng)2.O止、ddH20upto20止。2.篩選出12條RAPD引物進(jìn)行RAPD分析。12條RAPD引物共檢測到51個位點,其中多態(tài)位點占100%,Nei’s基因多樣度為0.3108,Shannon信息指數(shù)為0.4781;砒姬D標(biāo)記顯示象草具有豐富的遺傳多態(tài)性。3.基于RAPD擴(kuò)增構(gòu)建相應(yīng)的Nei’s遺傳距離矩陣,以及UPGMA樹圖。4.根據(jù)電泳結(jié)果記錄清晰可重復(fù)的RAPD條帶。當(dāng)用同一引物對9種象草DNA進(jìn)行電泳時,同一遷移率的條帶記為一個位點,擴(kuò)增帶存在時記為1,

3、否則記為O,用NTSYS軟件進(jìn)行運算并作圖。通過聚類分析得出,9種象草可明顯分為兩大類。由于這9種象草可明顯分為親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的兩大類,進(jìn)行象草雜交育種時可以嘗試分別采用兩大類象草中的一種作為親本材料,雜交得出的后代可能會有比較優(yōu)異的生產(chǎn)性狀和表型性狀,從而為象草的雜交育種提供科學(xué)依據(jù)和理論依據(jù)。關(guān)鍵詞:象草隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA簡單序列重復(fù)標(biāo)記條件優(yōu)化遺傳多樣性STUDYoNGENETICDIVERSITYOF尸E7V=;啦丁U^夕SSP.BYRAPDMARKERABSTRACT9Pennisetumssp.materialsfrom

4、GuangxiNanningwerestudiedforoptimizingtheRAPDreactionconditionsandprocedure.Penffisetum’SgeneticdiversityandrelationshipwerestudiedbyRAPDmarkers.Themajorresultsshowed嬲follows:1.TheobtainedoptimumschemewasfoundonreactionsystemforRAPD—PCR:10xPCRBuffer2.0I-tL、dNTPs(eachlO

5、mM)O.4肛L、primer(10pM)1.2止。、M92+(25mM)1.5此、TaqE(5U/此)0.4此、DNA(10ng)2.0此、ddH20upto20}此.2.TheanalysisofRAPDmarkershowedthat12RAPDprimersamplifiedatotalof51seorablemarkers,percentageofpolymorphiclociWas100%,Nei’sgeneticdiversityandshannon’Sinformationindexwere0.3108and0.47

6、81.TheresultsofRAPDsilowedthatthegeneticdiversityofforageresourcesonpennisetumWasrich.3.ThematrixesofgeneticdistanceandUPGMAclusterwereestablishedonRAPDfingerprint.4.TheclearandreproducibleRAPDbandswererecordedaccordingtotheelectrophoresisresults.Intheamplificationprod

7、uctsbythesameprimer,bandswiththesamemobilitywererecordedtoalocus,"l’'Wasrecordedwhenthebandexisted.Otherwise,"0’'WaSrecorded.NTSYSsoftwareWasusedforcalculationandmappingaccordingtothedata.Byclusteringanalysis,9kindsofPennisetumssp.canbeclearlydividedinto2categories.Bec

8、ausethese9kindsofPennisetumssp.canbeclearlydividedintotwodistantcategories,wecantrytousetwoPennisetumssp.fromdifferen

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