陣列芯片在人乳頭瘤病毒基因分型檢測中的應用評估.pdf

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1、分子診斷與治療雜志2009年11月第1卷第4期JMolDiagnTher,November2009,Vol.1No.4·227··論著·寡核苷酸微陣列芯片在人乳頭瘤病毒基因分型檢測中的應用評估汪圣強1★杭莉虹1錢盼盼1高杰1胡守旺2[摘要]目的探討寡核苷酸微陣列芯片技術(shù)在人乳頭瘤病毒(HPV)檢測中的實用價值。方法使用HPV寡核苷酸微陣列芯片試劑盒對227例宮頸拭子樣本進行16種高危型(HPV-16,18,31,33,35,39,45,51,52,53,56,58,59,66,68,CP8304)和5種低危型(6,11,42,43和44)檢測,所檢測的樣本為HC2探針捕捉法檢

2、測所得到的HPV高危型和低危型樣本,用以評估該DNA微陣列試劑的性能。結(jié)果190例經(jīng)HC2法檢測為高危型HPV陽性以及30例被HC2法檢測為低危型的樣品被寡核苷酸微陣列芯片試劑盒檢測出具體的高危和低危HPV型別,總共檢測出13種高危型和5種低位危型HPV亞型,在高危亞型中,各型檢出率分別是16型26.01%、58型20.18%、52型14.71%、68型7.59%、31型7.13%、33型6.37%、66型6.24%、18型4.05%、59型2.18%、39型1.10%、56型1.50%、45型1.40%、51型1.07%;在低危亞型中,各型檢出率分別為6型45.43%、11

3、型29.70%、42型14.11%、43型5.89%和44型5.00%。單一HPV亞型感染及2種、3種HPV亞型混合感染分別為60.46%、29.89%、9.65%。7例經(jīng)HC2檢測為高危型,但寡核苷酸微陣列芯片試劑盒未能檢測出HPV的具體型別,寡核苷酸微陣列芯片試劑盒與HC2法高危型HPV檢測結(jié)果的符合率為96.92%(220/227)。結(jié)論HPV寡核苷酸微陣列芯片試劑盒與HC2法高危型HPV檢測陽性符合率高,并可以明確具體分析21種HPV型別,是一種準確、高效、經(jīng)濟的HPV型別檢測方法,可用于HPV的常規(guī)基因型分型診斷及人群篩查。[關鍵詞]HPV;基因分型;寡核苷酸微陣列

4、芯片試劑盒ApplicationevaluationofoligonucleotidemicroarrayforhumanpapillomavirusgenotypingWANGShengqiang1★,HANGLihong1,QIANPanpan1,GAOJie1,HUShouwang2(1.WuxiEntry-ExitInspectionandQuarantineBureau,Jiangsu,Wuxi214101,China;2.DaAnGeneDiagnosticCenterofYat-senUniversity,Guangdong,Guangzhou510665,Ch

5、ina)[ABSTRACT]ObjectiveToexploretheapplicationvalueofoligonucleotidemicoarrayforhumanpapillomavirus(HPV)detection.Methods227samplesofdacronswabsaretestedbyOligonucleotideMicoarraykitforHPVgenotypingof16highrisksubtypes(HPV-16,18,31,33,35,39,45,51,52,53,56,58,59,66,68,CP8304),and5lowrisksubt

6、ypes(HPV6,11,42,43,44),thesampleswereHC2kittestedforhighriskandlowrisksubtypes,beintendedforperformanceevaluationoftheOligonucleotideMicoarraykit.Results190highriskand30lowriskHPVsubtypepositivecasesweregenotypedsepciifcallybyOligonucleotideMicoarraykitviablindassay.13highriskHPVgenotypeswe

7、redetected,namelyHPV16(26.01%),58(20.18%),52(14.71%),68(7.59%),31(7.13%),33(6.37%),66(6.24%),18(4.05%),59(2.18%),39(1.10%),56(1.50%),45(1.40%),51(1.07%),and5lowriskHPVgenotypesweredetectedas6(45.43%),11(29.70%),42(14.11%),43(5.89%)and44(5.00%).Thedetecti

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