H1N1亞型豬流感病毒HA和NA基因雙重RT-PCR定型檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用-論文.pdf

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1、中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào)2014,22(4):29·34ChineseJournalofAnima1InfectiOUSDiseases·研究論文·H1N1亞型豬流感病毒HA和NA基因雙重RT-PCR定型檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用溫肖會(huì),蔡春梅,魏文康,翟少倫,呂殿紅,賈春玲,袁潔,黃忠,周秀蓉(廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動(dòng)物衛(wèi)生研究所。廣州510640)摘要:為了建立適用于臨床診斷的H1N1亞型豬流感病毒快速檢測(cè)方法,本研究根據(jù)GenBank已登錄的H1N1皿型豬流感病毒HA和NA基因序列設(shè)計(jì)RT-PCR擴(kuò)增引物,

2、以H1N1亞型豬流感病毒、H3N2亞型豬流感病毒、豬瘟病毒和豬學(xué)殖與呼吸綜合征病毒為試驗(yàn)對(duì)照,通過(guò)優(yōu)化RT-PCR反應(yīng)條件和反應(yīng)體系,建立了H1NI亞型豬流感病毒HA和NA基因雙RT-PCR定型檢測(cè)方法。同時(shí),運(yùn)用H1Nl亞型豬流感病毒血凝和血凝抑制試驗(yàn)方法和本研究建立的方法對(duì)165份豬病料樣品進(jìn)行了對(duì)比驗(yàn)證。結(jié)果表明,本研究建立的H1N1亞型豬流感病毒雙重RT-PCR具有良好的特異性、敏感性、重復(fù)性,所擴(kuò)埋的目的基因片段大小分別為428bp和678bp左右,可檢出最小基因組RNA濃度為2.9×

3、10一g/L。本研究建立的方法和tI1N1亞型豬流感病毒血凝和血凝抑制試驗(yàn)方法均從同一份豬肺臟樣品中檢測(cè)出H1N1亞型豬流感病毒,其余樣品中均未檢出ttlN1亞型豬流感病毒,兩種方法符合率為100%。本研究建立的方法適用于H1N1亞型豬流感病毒雙基因定型檢測(cè),可在H1NI亞型豬流感病毒流行病學(xué)調(diào)查和臨床診斷中應(yīng)用。關(guān)鍵詞:HINI亞型豬流感;雙重RT-PCR方法;HA基因;NA基因中圖分類(lèi)號(hào):$852.659.5文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):1674.6422(2014)04—0029.06DoUBL

4、ERT-PCRMETHoDSFoRDETECTIoNoFHAANDNAGE_ESoFH1N1SUBTYPESWINEINFLUENZAVIRUSWENXiao—hui,CAIChun—mei,WEIWen—kang,ZHAIShao—lun,LVDian—hong,JIAChun—ling,YUANJie,HUANGZhong,ZHOUXiu—rongrInstituteofAnimalHealth,GuangdongAcademyofAgriculturalSciences,Guangdong

5、51064~China)Abstract:TodevelopareliablediagnosticmethodforH1N1subtypeSwineinfluenzavirus.doubleRT-PCRmethodsW:redevelopedusingprimersdesignedaccordingtothesequencesofHAandNAgenesofH1N1SubtypeswineinfluenzavirusinGenBank.Theamplifiedgenefragmentswere4

6、28bpforHAand678bpforNA.ThereactionconditionswereoptimizedandminimaldetectableRNAconcentrationwas2.9x1O。LJMeanwhile,themethodhadnoreactionwithH3N2subtypeSwineinfluenzavirus,classicalSwinefevervirusandPorcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus.This

7、methoddevelopedhereissuitablefordoubl:genetypingdetectionandalsoforearlydiagnosisandepidemiologicalinvestigationofH1NIsubtypeSwineinfluenzavirus.Keywords:H1N1subtypeSwineinfluenzavirus;doubleRT-PCR;HAgene;NAgene收稿日期:2013—12-2[)基金項(xiàng)目:廣東省科技計(jì)劃社會(huì)發(fā)展項(xiàng)目(2010

8、B080701024);廣東省科技計(jì)劃特定任務(wù)項(xiàng)目(2011B06070()075);廣州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(2012224—26)作者簡(jiǎn)介:溫肖會(huì),女,碩士,助理研究員,主要從事動(dòng)物疫病診斷和動(dòng)物傳染病學(xué)研究通信作者:魏文康,E—mail:wwk188@tom.com中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào)2014年8月流感病毒(Influenzavirus,IV)屬于正粘病1.1.2主要試劑和工具酶一步法反轉(zhuǎn)錄RT—PCR試劑毒科(Orthomyxoviridae)、流感病毒屬,根據(jù)核盒、DNAMarker(DL20

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